《警察特工队》是SBS电视台千禧年的反恐怖力作，它以惊心动魄的场面、真实的情感开创了警匪片的新时代。它打破了传统警匪片的条条框框，从故事的情节、故事的主题到人物的性格都给人一个新的感受，情节生动感人，人物栩栩如生，时而催人泪下、时而激人振奋……

故事以两条线索平行发展，一条线是特种警察队员与恐怖集团尖锐的斗争较量，另一条是对立双方人与人之间的感情纠葛，情节发展十分迅速，警官们面对挑战的勇气和智慧，故事引人入胜。

剧情主要围绕着与国际暗杀集团正面交锋的特工队员的活动和他们之间的友情、爱情和背叛展开故事情节的一部人生剧。剧中金锡勋饰演电脑工程出身的特工队员李东河。李东河7岁失去双亲，亲眼目睹唯一的哥哥东植被杀经过，发誓要报仇雪恨，于是成为一名特工队员。他与偶然相识的一级杀手郑丹妃一见钟情，开启了两人坎坷的爱情之路。李宗原饰演特殊战士出身的一级特工队员俞强驻，拥有动物般敏锐的感觉。从小以为自己是遗腹子，“死而复生”的父亲让他烦恼不已。原来杀害好友东植的凶手竟然是自己的亲生父亲朴太亨。俞强驻与活泼好动的队员吴尚姬的嘻闹爱情也别开生面。