瓜氨酸（Citrulline）化学式为C6H13N3O3是一种α-氨基酸，是从鸟氨酸及胺基甲酰磷酸盐在尿素循环中生成，或是通过一氧化氮合酶（NOS）催化精氨酸的副产物。

患有类风湿性关节炎的病人（约80%）会发展一套免疫反应对抗带有瓜氨酸的蛋白质。虽然这种反应机制的起因不明，但其抗体可以帮助这类病的诊断。

瓜氨酸是一种α-氨基酸，因最先从西瓜中获取，而得名“瓜氨酸”。

化学式：C6H13N3O3

分子量：175.19

瓜氨酸为白色结晶或结晶粉末，有酸味，溶于水、不溶于乙醇和乙醚。

瓜氨酸是从鸟氨酸及胺基甲酰磷酸盐在尿素循环中生成，或是通过一氧化氮合酶（NOS）催化精氨酸生成NO的副产物。

首先，精氨酸会被氧化为N-羟基精氨酸，然后再行氧化成瓜氨酸并释出一氧化氮。

当瓜氨酸仍然是氨基酸时，由于它不是为脱氧核糖核酸而编码，所以是不会在蛋白质生物合成中嵌入蛋白质内，不过仍然有部份蛋白质含有瓜氨酸。这些瓜氨酸是由胜肽精胺酸亚氨酶（PAD）所产生，在瓜氨化的过程中将精氨酸转化为瓜氨酸。一般含有瓜氨酸的蛋白质包括有人脑MBP（MBP）、聚角蛋白微丝蛋白及一些组蛋白。如纤维素及波形蛋白能从细胞死亡及组织发炎中被瓜氨化。