浙江省中山医院（又名浙江省针灸推拿医院），成立于1961年，前身为浙江中医学院附属门诊部。作为一家中医医院，浙江省中山医院为浙江省卫生厅所属省级医疗机构，提供针灸推拿服务。2003年9月18日，经过浙江省卫生厅批准，附属针灸推拿医院实行“院系和一”，与浙江中医学院针灸推拿系合并，成立浙江省针灸推拿医院。

1961年，浙江中医学院门诊部正式挂牌门诊，设址于庆春路老浙大舜水馆。

1970年，门诊部因学院与浙江医科大学合并而撤销。

1975年，门诊部恢复并改址于浙江中医学院黎洲馆。

1999年，门诊部经省卫生厅批准升格为省级医疗机构。

2002年，门诊部迁至庆春路中医大厦。

2003年，门诊部与原浙江中医药大学针灸推拿系“院系合一”。

成立浙江中医学院附属针灸推拿医院。

2005年，医院增挂浙江省针灸推拿医院院名。

2006年，医院升格更名为浙江中医药大学附属第三医院。

2008年，医院与原浙江省邮电职工医院合并重组。

2009年，医院增设莫干山路院区，增挂浙江省中山医院院名。

2011年，医院经省卫生厅批准升格为浙江省三级乙等中医医院。

2013年，医院被国家中医药管理局授予三级甲等中医医院称号。

2020年9月，由浙江医院携手西湖区疾控系统党建工作组、浙江中医药大学附属第三医院（浙江省中医医院）等其他5所医院、迪安诊断技术集团股份有限公司联合发起成立西湖公共卫生红色联盟。

设有内科、外科、针灸科、推拿科、骨伤科、康复科、肿瘤科、神经内科、干部科、妇科、儿科、眼科、耳鼻咽喉科、口腔科等25个临床科室和1个重症监护室。

医院现有职工1057人，高级职称132人，其中卫生部和浙江省有突出贡献中青年专家1人、中医药高等学校教学名师1人、浙江省卫生领军人才1人、全国老中医药专家学术经验继承指导老师6人、浙江省名中医4人、浙江省杰出青年基金获得者1人、浙江省卫生创新人才1人、浙江省151人才9人。