中山大学计算机科学系成立于1979年，是我国最早招收计算机本科专业的单位之一，也是
华南地区最早招收计算机硕士、博士的单位之一。现与计算机软件研究所、计算机应用研究所等单位同属信息科学与技术学院。
现有
计算机软件与理论博士点，计算机软件与理论、
计算机应用技术两个硕士点，计算机技术和
软件工程两个工程硕士专业学位点，
计算机科学与技术、
网络工程和软件工程等三个本科专业，其中计算机科学与技术专业是
广东省首批名牌专业。计算机科学系现有教授、副教授30余名，专职教师中具有博士学位或正在攻读博士学位的占50%以上。在这支队伍中，既有学术造诣深厚的著名学者，更有一批朝气蓬勃的中青年骨干。计算机系一直重视与国内外的学术交流和合作，许多教师曾到国外留学或进修访问，每年都有一批教师和学生到国外著名大学进修、学习或参加学术活动。近年来，我系承担了一大批国家、省部级及地方科研项目，包括国家自然基金重点项目、国家863高新技术项目、国家重点攻关项目等，仅2003年就获国家自然科学基金项目5项，有多项重要应用成果通过国家、省部级以上鉴定并获奖。每年都有一批高质量学术论文和著作出版和发表，据初步统计我系已有百余篇论文被SCI、EI、ISTP等索引收录。
经过多年努力，本系建立了
电子商务研究所、数据库与协同软件研究中心、信息安全技术研究室、信息学研究室、
人工智能与模式识别研究室等科研机构。建有
计算机网络技术专业、计算机体系结构、软件新技术、
软件工程等实验室，拥有IBM AS400小型机，Sun E3000多CPU服务器和多CPU的Ultra 2
工作站等先进设备的实验室，为教学科研提供了良好条件，为同学们进一步深造提供了条件。
长期以来，我系一直是莘莘学子报考的热点。近年的入学分都在710分（标准分）以上，多年高居我校理科专业入学分数之首。每年获学校新生凯思奖学金（每人4万元）的人数也名列全校前茅。我系长期重视教学改革和教育质量管理，教学质量不断提高，我系学生在ACM国际程序大赛一直保持全国前列。
计算机科学系的毕业生一直供不应求，深受社会各界的欢迎。他们当中很多人，已成为所在单位的重要骨干力量。同时，本系每年都有一批优秀本科毕业生被推荐免试攻读硕士研究生（包括推荐到
中国科学院、
清华大学、
复旦大学、
南开大学以及本校等）。
此外，为适应社会发展需要，提高全民族素质，计算机科学系积极开展多种形式办学，包括计算机软件与理论专业研究生课程进修班，各类高等继续教育本、专科计算机类专业等，并负责
广东省高等教育自学考试 中计算机
信息管理（本、专科）、计算机应用（本、专科）、计算机网络（本科）等三个专业的主考工作。每年都有一批在职人员获得
计算机硕士学位和
学士，为社会培养了一批又一批合格人才。