1984年南京师范大学计算机学科开始正式招收计算机专业的本科生。1994年6月，以数学系计算机科学教育专业为基础划出部分教师单独建立计算机科学系。1999年5月计算机科学系与数学系、计算中心等单位合并成立数学与计算机科学学院。2009年4月，学校决定拆分数学与计算机科学学院，成立计算机科学与技术学院。目前计算机科学与技术学院下设4个系和4个中心，包括智能技术系、计算机软件系、网络与信息安全系、管理科学与工程系、计算机中心、计算机专业实验教学中心、江苏省信息安全保密技术工程研究中心、南京市管理信息化工程中心。

计算机科学与技术学院通过人才引进和自身培养，师资队伍得到进一步加强，学科梯队得到进一步的优化，现有教授12人（含博士生导师6人），副教授及博士34人，硕士生导师23人，入选江苏省“青蓝工程”中青年学术带头人1人、江苏省“333工程”培养人选1人，江苏省“六大高峰人才”1人，学校“百人计划”培养人选2人、学校杰出人才培养人选2人。

计算机学院非常重视人才培养质量，加强教育教学改革，注重学生实践创新能力培养。近年来出版教材50多部，其中9部被列为国家“十一五”规划教材，获江苏省高等教育教学成果奖二等奖2项、省级精品课程1门。学院目前设有“计算机科学与技术”、“软件工程”和“信息管理与信息系统”3个本科专业。学生参加全国数学建模、软件设计等项目的比赛均获得若干奖项。近年来，有的学生毕业后到到国外留学，有的毕业生到中科院、中国科技大学、南京大学、东南大学、北京理工大学、厦门大学等985高校攻读计算机专业硕士学位，有的毕业生到著名IT企业工作，如Motorola、阿里巴巴集团、搜狐等；本科生就业率达98%以上。学院研究生的培养质量和科研创新能力得到进一步提高，有3名研究生学位论文获得江苏省优秀硕士论文，研究生就业率100%，且就业质量高。计算机学院毕业生满意度在95%以上。

计算机科学与技术学院目前具有“计算机科学与技术”和“管理科学与工程”两个一级学科硕士学位授予权，下设“计算机应用技术”、“计算机软件与理论”、“管理科学与工程”3个二级硕士学位点和“计算机技术”工程硕士学位点。“计算机科学与技术”为校级一级重点学科。设有江苏省信息安全保密技术工程研究中心、江苏省智能信息技术与软件工程实验室。计算机专业实验教学中心被评为江苏省实验教学示范中心。参与国家“十五”“211工程”重点学科建设，主持国家“211工程”三期重点建设项目“新型智能信息处理技术研究”，在机器学习与数据挖掘、密码学与信息安全、智能技术与应用、自然语言处理等领域取得一系列科研成果。

近年来计算机学院共获得了17项国家自然科学基金项目，11项省部级项目，与外单位合作获1项目国家863项目，科研项目立项创计算机学科最好水平；在IEEE Transaction系列、《Pattern Recognition》、《Neurocomputing》、《计算机学报》、《软件学报》等权威期刊以及国际学术会议发表论文500多篇，SCI/EI收录论文200多篇，获国家发明专利10多项、实用新型专利20多项、软件著作权10多项。

2015年主要科研论文：

1.A manifold learning framework for both clustering and classification, Knowledge-Based Systems, SCI核心, 蔡维玲

2.Exponential Wavelet Iterative Shrinkage Thresholding Algorithm for compressed sensing magnetic 共振 imaging, INFORMATION SCIENCES, SCI核心，张煜东,Dong, Zhengchao(学),Phillips, Preetha(学),王水花，吉根林，杨继全

3.Comment on 'Principles, developments and applications of 计算机 vision for external quality inspection of fruits and vegetables: A review (Food Research International; 2014, 62: 326-343)', FOOD RESEARCH INTERNATIONAL, SCI核心，张煜东,Wu, Lenan(学),王水花，吉根林

4.On obtaining Piled OWA operators，International Journal of Intelligent System，SCIE，金乐圣(学),钱钢

5.Efficient revocable certificateless encryption against decryption key exposure，IET Information Security，SCIE，孙银霞，张福泰，沈丽敏