福州市体育运动学校经福建省人民政府1989年第76次常务会议决定，福建省教育委员会批准，于1989年10月在福州市人民体育场创办。

学校归福州市体委和福州市教委双重领导，以市体委为主。系全日制普通中等专业学校，学制3年，列入普通中等专业学生招生计划，经费和毕业生分配均由福州市人民政府统筹安排。

办学目标主要为国家培养德、智、体全面发展的省以上高水平优秀运动队后备人才与为社会培养合格的中级体育人才。学生满额为240人。1994年有教职员工34人，其中高级教师2人，高级教练1人。已招有3年制和4年制(预备班)各1个班，已毕业3届共100人。

2021年5月16日下午，2021全国U15篮球比赛女子组预赛（遵义市赛区）落下帷幕，经过为期7天56场比赛的激烈角逐，最终福州市体育运动学校获得赛区第一名。