小四孢菌属（学名：Microtetraspora）是放线菌门、放线菌纲、放线菌亚纲、放线菌目、小多孢菌科的一属细菌，也属于链孢囊菌科。其模式种为青色小四孢菌（Microtetraspora glauca）。代表种为青色小四孢菌。

小四孢菌属的菌丝多分枝，在琼脂上部形成密层。气丝上产生4个孢子的短链，孢子数目可能有时3或5个。孢子丝先一分为二，顶端部分分裂为两个孢子，基部再分为4个孢子。孢子柄时常与气丝成45°的角度，使孢子链排列成麦穗状。革兰氏阳性，不抗酸。细胞壁一般为Ⅲ型，但青色小四孢菌和褐色小四孢菌的胞壁还含赖氨酸、甘氨酸、内消旋二氨基庚二酸和迹量的左旋二氨基庚二酸。