生理活性物质是一类能够对人体或动物的生理过程产生明显作用的化合物。这些物质包括但不限于神经递质
乙酰胆碱、神经生长因子、
多肽、
多糖、各种活性酶及其
前体、辅酶以及辅基等。
人体所需的三大主要营养物质——
蛋白质、脂肪和
糖类通常需要从外部获取。然而，在某些情况下，当其中一种营养物质不足时，它们可以通过体内存在的生理活性物质的作用相互转化、替代和补充。此外，矿物质和水分也主要来自外界，而
维生素则有部分可通过正常肠道菌群获得。
肝脏作为人体内最大的
化学加工厂，能合成多种重要的生理活性物质，如胆汁和超氧化物歧化酶。胰脏不仅生产胰蛋白酶原，后者进入胃部后激活成胰蛋白酶以帮助消化食物，而且还能分泌
胰岛素进入血液，参与血糖的调节。脾脏也能合成增强免疫力的生理活性物质，从而参与免疫系统的调控。
健康的肠道菌群是许多生理活性物质的重要来源。在分解食物的过程中，肠道菌群会释放出大量的活性
维生素和其他必需的
生物分子，以支持人体的各种
生命活动。因此，肠道菌群失调或患肠道疾病的人往往体质较弱且易受感染。