张崇根，自1962年起从事台湾史和
高山族的研究工作。他在
民族学理论方面有多部著作，并在国内外学术刊物发表了数十篇论文。
张崇根自1962年开始致力于台湾史和高山族的研究。他出版了多部专著，其中包括《临海水土异物志辑校》（1981年）、《台湾历史与高山族文化》（1992年）、《台湾文化卷》（1997年）、《临海水土志》辑注（1998年）以及《
台湾世居少数民族研究》（2002年）。此外，他还参与编写或主编了十多种
民族学理论方面的书籍，并在国内外学术刊物上发表了数十篇论文。
张崇根担任多项社会职务，包括
中央民族大学民族学与社会学学院客座教授、
全国台湾研究会理事、特邀研究员，以及台湾少数民族研究会副会长兼秘书长。2001年至2003年间，他曾作为
海峡两岸关系研究中心的驻会研究员。
张崇根的代表作之一是《台湾四百年前史》。这本书广泛引用了古今中外的246种著作，涉及220位学者在论文集、学术研讨会和66种期刊中的252篇论文，以及16种报纸上的多篇报道。书中提供了详细的参考书目，并对论文和报道进行了脚注。注释以章节为单位，首次出现时进行全面注解，之后则简化形式。例如，《台湾考古学民族学概观》一书由[
日本]
鹿野忠雄撰写，
宋文薰翻译，1955年由台湾省文献委员会出版，书中第115页的内容可以简称为鹿野著、宋译，1955：115。类似的，对于其他论文和报道，只需注明作者姓名、期刊名称即可。
张崇根的研究方法遵循实事求是的原则，他尽力使用台湾
考古学的第一手资料，如发掘报告和调查报告，在最新的研究成果基础上，还原历史事件的真实面貌并探究其源头。他的假设通过多重证据法来验证，综合考虑了考古学、
语文学、
民族学、地质学、
古人类学和
古文字学等多个领域的资料和成就。在选择最佳证据的同时，他也提出了自己的见解。
张崇根的研究成果支持了20世纪40年代
日本学者
鹿野忠雄的观点，即台湾先史文化的根基源自中国大陆，且经历了多次影响。具体例子包括台湾
旧石器时代的“
砾石石片器”和“小石器传统”，以及
新石器时代的各种工具和器具。这些发现表明，台湾的历史文化与华北地区有着显著的相似之处。此外，自公元3世纪以来，中原王朝的政治影响力已经延伸至台湾，这进一步证明了台湾史是
中原地区史不可分割的一部分。然而，一些政治力量试图将台湾史从中国史中分离出来，这种行为遭到了许多人的批评和反对。