水样采集与保存是针对农田生态系统中不同类型的水样的收集和保护过程。这些水样包括雨水、灌溉水、径流水和土壤渗漏水等。为了确保水样的质量和准确性，采集和保存方法应根据具体的研究需求进行规范操作。

雨水的采集可以从气象站的量雨筒中直接获取样本，也可以通过在露天放置容器，在降雨期间接收水样。

灌溉水的采集应在灌水沟渠中进行，或在水库、山塘、河流、水井等水源处取样，需要注意的是，不应在施肥过的稻田中采集。

径流水分可通过测量径流量设施的出水口进行采集。

土壤渗漏水分可以通过埋设地下排水管或建立专门的排水采集器来进行采集。

采样瓶应事先清洗干净，通常选用具有磨口塞的玻璃瓶或螺口塑料瓶。如果需要测定硅含量，则必须使用塑料瓶。

在采样过程中，首先需要用所采集的水样冲洗采样瓶2至3次，然后不要将瓶子完全装满，预留5至10毫升的空间，以防温度上升导致瓶塞被顶开。采样完成后，应及时拧紧瓶塞，防止泄漏。

带回实验室的水样，对于易发生变化的成分和性质，如铵态氮、硝态氮、亚硝态氮和pH值等，应尽快进行分析。若无法立即分析，应将样品存放在5℃以下的阴凉环境中，并根据分析要求选择性地加入防腐剂（如三氯甲烷、硫酸铜、氯化汞等），或添加酸、碱调节pH值，以抑制微生物活性。