跨境银行间支付清算有限责任公司于2015年07月31日成立，注册地位于上海市黄浦区中山东一路15-1号大楼，法定代表人为时文朝，现任副总裁为邬向阳。跨境银行间支付清算有限责任公司接受中国人民银行的监督、管理和指导，根据《人民币跨境支付系统业务规则》《人民币跨境支付系统业务操作指引》以及《人民币跨境支付系统参与者服务协议》等相关制度规则，负责人民币跨境支付系统（CIPS系统）的开发运行维护，开展参与者服务、产品创新、标准建设和市场拓展等工作，为境内外金融机构和中国人民银行允许的其他机构提供人民币跨境支付清算服务、数据处理服务、信息技术服务和投资人委托的其他相关业务，以及经中国人民银行批准的其他业务和服务。

2022年6月26日，跨境清算公司宣布，上线基于CIPS标准收发器的创新增值功能 —— CIPS支付透镜服务。

跨境清算公司的经营范围包括为金融机构和中国人民银行允许的其他机构提供人民币跨境支付清算服务，数据处理服务，信息技术服务，投资人委托的其他相关业务，以及经中国人民银行批准的其他业务。这些服务旨在支持境内外金融机构的跨境人民币业务，提升支付效率和便利性。除依法须经批准的项目外，跨境清算公司凭营业执照依法自主开展经营活动。