北京市健宫医院创立于1953年，前身为北京市建筑工人医院、建设部总医院，于2021年10月获批转型升级为三级中西医结合医院。

1953年，医院创建，曾用名有北京市建筑工人医院、建设部总医院。

2003年，医院被宣武区政府指定为放心医院。

2003年，医院被北京市政府评为抗击“严重急性呼吸综合征”先进单位。

2010年，医院通过国际医院认证联合委员会（JCI）认证。

设有心外科、胸外科、普外科、骨科、泌尿外科、神经外科、妇产科、心内科、神经内科、消化内科、内分泌科、呼吸内科、肾内科、综合内科、小儿科、耳鼻喉科、眼科、口腔科、皮肤科、中医科、康复理疗科、急诊科、感染疾病科、重症监护病房、麻醉科、药剂科、检验科、超声科、医学影像科、心功能科、病理科、体检科、特需病房和特需门诊等34个科室。

医院设临床、医技科室33个，设有CCU、ICU和VIP病房等。医院设备先进，拥有美国GE大型心脏血管造影机、全身螺旋CT、大型X光机、电子胃镜、彩超、脑彩超、高压氧舱、心肺功能测定仪、监护仪、全自动生化分析仪、血透机等50余台大型现代化医疗设备。

2002年获得亚洲首届医院管理大会“管理品牌奖”。

2002年被国际医院管理协会正式接纳为“A级会员”单位。

2003年北京市首家通过ISO9001:2000/ISO9002：1994EN46002:1996/ISO13488:1996认证。

2003年6月被宣武区政府指定为放心医院。

2003年被北京市政府评为抗击“严重急性呼吸综合征”先进单位。

2003年被首都创建精神文明建设委员会授予首都公共卫生文明单位。

2003年被北京市卫生局授予卫生统计先进单位。

2004年被北京市劳动和社会保障局医疗保险中心授予A级A类医疗保险定点医院。

2004、2005、2006连续三年在全市医保评选中获一等奖。

2004年、2005年、2006年连续被北京市爱国卫生运动委员会评为爱国卫生先进单位。

2005年、2006年被北京市国家安全局评为首都维护国家安全先进单位。

2004年、2005年、2006年连续被宣武区精神文明建设委员会评为宣武区文明单位。