马尔康寺，原位于四川省阿坝藏族羌族自治州州府所在地今马尔康镇民族文化宫处，“文化大革命”中被毁。现今的马尔康寺坐落在原寺背后的山腰上，是20世纪80年代末新修的寺院。

该寺原系苯教，后改奉格鲁派，是马尔康市独布”寨之寺院。据史料记载，约在14世纪末，在原寺址上已有小型的一座苯教寺庙。约在景泰元年(1450年)，大喇嘛卓巴让波为扩建后的寺院命名为“马尔康雍忠林”。清乾隆四十一年(1776年)，清朝用兵征剿清平大小金川之战，尤恨率民反抗的苯教，皇帝称其为“本布尔邪教，下令禁教”。苯教遭到政令取缔，受到毁灭性打击，但马尔康地区仍然信奉苯教，清光绪十一年(1885年)，格鲁派堪布钦日阿斯丹巴碧日嘉措组织僧侣武装，兵分几路进攻马尔康，攻占了“马尔康雍忠林”，并改为“马尔康达尔基林”。建国后，马尔康市为州佛教协会办公所在地。