新疆三肋果的茎直立或上升，高30-70厘米，圆柱形，中空，有细沟纹，无毛，上半部多分枝。叶卵状矩圆形或矩圆形，长2-4厘米，宽1-2.5厘米，羽状全裂，末次裂片狭条形，顶端短尖头，两面无毛，无叶柄，基部稍扩大。
头状花序数个或多数生于茎枝顶端，直径2-3厘米，花序梗长，顶端膨大；总苞半球形，直径7-10毫米；总苞片3-4层，外层
披针形，苍白绿色，无明显的膜质边缘，中内层矩圆形至倒披针形，边缘狭膜质，白色或淡绿色；
花托半球形或宽圆锥形。舌状
花舌片白色，平展，长约10毫米，宽约3.5毫米；
管状花黄色，花冠长1.8毫米，上半部扩大，冠檐5裂，裂片顶端有红色树脂状腺点。
瘦果长2毫米，
褐色，多皱纹，有3条苍白色的肋，背面顶端有2个红色圆形腺体。冠状冠毛短，坚硬近全缘。花果期9月。