温州医科大学图书馆是温州医科大学文献信息收藏、整理、存储和传播的中心，是温州医科大学教学、科研不可或缺的强有力后盾。其主馆位于温州茶山校区。
1958年8月，
浙江大学医学院从
杭州市分迁部分员工、设备和图书来到
温州市，成立“浙江第二医学院”，“浙江第二医学院图书馆”随之诞生。同年底，学校改名为“温州医学院”，馆名相应改为“温州医学院图书馆”，2013年，学校更名为“温州医科大学”，馆名亦更为“温州医科大学图书馆”。多年来，该馆围绕学校教学、科研、医疗等中心工作，在资源建设、读者服务、教学培训、学术科研、数字化建设等方面取得了显著成绩，分别荣获
浙江省教育厅和浙江省高校图书情报工作委员会授予的“浙江省先进高校图书馆”、“
浙江省高校数字图书馆项目建设先进集体”等称号。
本馆建筑面积为28000平方米，分处茶山和学院路两个校区，其中茶山校区馆为主馆，位于校园教学区中心，楼高七层，设施齐全，环境优雅，设有各类书库、阅览室、检索终端座位、
多媒体视听座位、阅览座位和自修座位3000多个，满足了广大师生信息获取的需要和学校未来发展的需要。
截至2006年底，温州医学院图书馆总藏书量100万余册，订有纸质中外文期刊1200多种，形成以医学专业文献为主体，兼有人文、社会科学及自然科学文献的多种类型、多种载体的综合性馆藏体系。
该馆馆藏文献拥有丰富的纸质中、外文图书和期刊，并拥有各类数字资源，内容涉及全文期刊、文摘题录、学位论文、会议论文、百科全书、电子图书、考试学习平台、光盘镜像、视频等多种类型，共37个中外文数据库。形成了以医学为中心，兼及理、工、农、文等各门类、符合学校办学需要的馆藏体系。
本馆主要提供四大类服务项目：一是纸质书刊外借、阅览等传统服务；二是上机上网、联机查询、数字资源访问、文献复制、影音欣赏等；三是高层次的信息服务，如课题立项查新与成果鉴定、文献检索、文献传递、参考咨询等；四是为ZADL温州分中心成员馆及全省高校提供资源共建共享、信息传播、人员培训、技术指导、学术活动等。
作为学术性服务部门，该馆高度重视馆员的学术研究与交流。积极围绕文献信息服务开展科研活动，完成了《图书馆馆藏资源定位技术的研究与应用》、《数字资源共享及可持续发展》等省市级课题17项。共发表论文181篇，其中在国家级核心期刊上发表42篇，1篇论文被EI收录；9篇论文分获全国图书学会、
浙江省高校图书馆优秀成果
二等奖、
三等奖和
温州市社科优秀成果二等奖、自然科学优秀论文三等奖。该馆还保持与其他图书馆和信息机构的学术交流，多次举办或参与全国性、全省性和地区性学术交流会议。
由分管校领导直接领导，实行馆长负责制。设有办公室及现代服务部、科技情报中心、
数字图书馆研究与技术中心、资源部、流通部、阅览部等7个部门。拥有工作人员50人，其中高级职称6人、中级职称26人，中高级职称者占总人数的64%，并有硕士9人，是一支年青化、知识化、专业化的服务队伍。