2018年3月，中共中央印发《
深化党和国家机构改革方案》（摘要），为统一行使全民所有自然资源资产所有者职责，统一行使所有国土空间用途管制和生态保护修复职责，着力解决自然资源所有者不到位、空间规划重叠等问题，将国土资源部的职责，国家发展和改革委员会的组织编制主体功能区规划职责，住房和城乡建设部的城乡规划管理职责，水利部的水资源调查和确权登记管理职责，农业部的草原资源调查和确权登记管理职责，国家林业局的森林、湿地等资源调查和确权登记管理职责，国家海洋局的职责，
国家测绘地理信息局的职责整合，组建自然资源部，作为国务院组成部门。
具有管理地质勘查行业和石油、天然气、煤层气矿产资源探矿权、采矿权的审批登记的职能。其主要工作是：组织矿产资源、海洋资源调查评价；编制地质勘查规划并监督检查执行情况；管理中央级地质勘查项目，组织实施国家重大地质勘查专项；管理地质勘查行业和地质勘查资质；组织拟订石油、天然气、煤层气矿产资源战略、政策和规划，承担探矿权、采矿权管理，以及对外合作区块的审核和监督管理等。