结构模体（英语：structural motif）也称为结构基序，是链样生物分子（如蛋白质或核酸）中普遍存在且具有特征性的局部三维结构（超二级结构）单元模式。结构模体常为某种功能决定部位，可出现在各种不同的、演化上不相关的链样分子中。它们在蛋白质的生物学功能中起着重要作用，但相同的结构模体在不同蛋白质或酶中可能存在较大的功能差异。

核酸或蛋白质分子上的亚序列或亚结构。通常具有某种功能。

《生物化学与分子生物学名词》。

在蛋白质中，结构模体的例子包括但不限于以下几种：

- β发夹：由两个相邻的β链组成，它们通过转角连接在一起。

- 希腊钥匙：由连续的β链和α尾旋组成，形成一个紧凑的结构。

- 四股β链相互折叠形成三明治的形状：这种模体由四个β链组成，它们相互折叠形成一个稳定的三明治状结构。

- Ω环：由蛋白质链中的一部分形成的环状结构。

- 螺旋-环-螺旋：由两个α螺旋通过一个环状结构连接。

- 亮氨酸拉链：由两个α螺旋组成，它们通过亮氨酸残基相互作用形成稳定的结构。

- 螺旋-转角-螺旋：由两个α螺旋通过一个转角连接。

这些模体在蛋白质的功能中扮演着关键角色，它们可以参与蛋白质的稳定、分子间相互作用、催化反应等多种生物学过程。然而，即使是相同的结构模体，由于其所处的蛋白质环境和上下文的不同，其功能也可能有很大的差异。因此，结构模体为研究蛋白质功能提供了一个有趣且复杂的研究领域。