小鳔高原鳅（学名：Triplophysa microphysa）是花鳅科高原鳅属的一种鱼类，属于辐鳍鱼纲鲤形目。这是中国的特有物种，主要分布于新疆的阿克苏河等地。其模式产地也位于阿克苏河。

身体侧扁，但尾柄高度向尾鳍方向压低，尾柄起点处的 宽等于或大于尾柄高。头稍平扁。前后鼻孔紧邻，前鼻孔 瓣状。颌须末端伸达眼后缘之下方。背鳍基部起点离尾鳍 基部较离吻端为近，腹鳍基部起点与背鳍的第一或第二 根分枝鳍条基部相对，末端到达或超过肛门。无鳞。侧线 完全。背部在背鳍前后各有56个大褐斑，体侧有明显 或不明显的暗褐斑。鳔后室是一个很小的膜质室，前端有 一长度约是膜质室长度5倍的细管，细管和膜质室的整 个长度约为体腔的1/2。体长91121mm。

繁殖期为5-6月份。在产地曾有一定的捕捞量。