川州孔子鸟是与圣贤孔子鸟产于同一地层层位的同一模式种的原始鸟类。初描述为：个体较圣贤孔子鸟大，比较粗壮，是比圣贤孔子鸟更原始的鸟类。从其趾爪粗壮而不太弯曲的特征分析川州孔子鸟属为营地栖生活，由此可见，孔子鸟类群的生态习性已开始分化。所谓的种间差别是不存在的。所有属于这两个种的标本和当时大部分的标本一样归到圣贤孔子鸟中。这两个种普遍被认为是圣贤孔子鸟的同物异名。

1997年，侯连海依据化石产地为该属种鸟命名，种名“川州”是北票市古代的称谓。1999年，川州孔子鸟模式种取消。

川州孔子鸟是与圣贤孔子鸟产于同一地层层位的同一模式种的原始鸟类。初描述为：个体较圣贤孔子鸟大，比较粗壮，是比圣贤孔子鸟更原始的鸟类。从其趾爪粗壮而不太弯曲的特征分析川州孔子鸟属为营地栖生活，由此可见，孔子鸟类群的生态习性已开始分化。   （该区别特征为1999年模式种变更前的描述，后无效）

根据路易斯·恰佩（Luis M. Chiappe）带领的研究小组 (Chiappe u. a. 1999)研究，有两种作废：孙氏孔子鸟（Confuciusornis suniae）和川州孔子鸟（Confuciusornis chuonzhous），它们与圣贤孔子鸟（Confuciusornis sanctus）所谓的种间差别是不存在的。所有属于这两个种的标本和当时大部分的标本一样归到圣贤孔子鸟中。这两个种普遍被认为是圣贤孔子鸟的同物异名。