原绿藻（Prochloron）是蓝菌门（Prochlorophyta）和原绿藻属（Prochloron）的唯一种，属于原核生物。原绿藻是单细胞、草绿色的生物，主要聚生在珊瑚礁潮下带上部的壳状动物体上，特别是死珊瑚体上的海鞘类。也有个别原绿藻生长在活藻类如与多孔动物共生的角网藻的藻体的胶质动物体上。在光学显微镜下，原绿藻细胞球形，直径8～12微米，原生质体明显分为两部分：无色的中央区和翠绿色的周围区，没有细胞核和叶绿体。细胞为一层很薄的粘肽细胞壁所包围。

原绿藻门最早发现于60年代初，但当时人们以为它们是一类原始的绿藻,后来通过用电子显微镜仔细研究 ,发现它们和细菌、蓝藻一样属原核生物。原绿藻是单细胞球状体，直径在一微米。细胞壁成分中含胞壁酸，这是原核生物特有的成分。在光学显微镜下观察，细胞内可分为无色的中央区和绿色的周围区，没有细胞核、叶绿体和其他细胞器。在电子显微镜下观察，细胞中央是低电子密度区，其中含核质，相互连接成网状，无核膜和核仁的结构，但具核的功能，故称类核或原始核。周围一圈是类囊体和细胞质，类囊体通常单条，分布在细胞的外层，波折状平行于细胞壁，并埋在细胞质内，这种细胞结构与蓝藻相似。但类囊体表面光滑，没有藻胆体，同时在某些部位有 2条或2 条以上的类囊体互相叠合的现象，其光合色素含叶绿素a和b，这又同绿藻门相似。原绿藻的贮藏物质是1，4葡萄糖，并含绿藻淀粉那样的不分枝的直链淀粉。根据上述形态特征和光合作用色素组成，原绿藻介于蓝菌门和绿藻门之间，美国藻类学家雷文(Lewin)建议在原核生物界中除细菌门和蓝藻门外，新增— 原绿藻门(Phlorphyt),这一主张得到很多学者赞同。

在电子显微镜下，原绿藻细胞中央为低电子密度区，周围一圈是细胞质，内含有光合作用的类囊体和性能不清楚的多面体，但无其他细胞器。类囊体通常单条、表面光滑，无藻胆体，波折状地与细胞壁平行，在某些部位有2条或2条以上的类囊体互相叠合的现象，近似绿藻门，但不组成叶绿体。光合色素除了β-胡萝卜素及叶绿素a和叶绿素b，a/b比平均为5.6～6.0，比其他绿藻类a/b比(2～3)高得很多之外，还有玉米黄质、β-隐藻黄素、异隐藻黄素、海胆烯酮等叶黄素。细胞壁成分中含胞壁酸，这是原核生物特有的成分。在电子显微镜下观察，细胞中央是低电子密度区，其中含核质，相互连接成网状，无核膜和核仁的结构，但具核的功能，故称类核或原始核。原绿藻的贮藏物质是1，4葡萄糖，并含绿藻淀粉那样的不分枝的直链淀粉。

原绿藻门最早发现于60年代初，但当时人们以为它们是一类原始的绿藻。后来通过用电子显微镜仔细研究，发现它们和细菌、蓝藻一样属原核生物。多年来人们认为所有原核的藻类都属于蓝菌门，因此当R·A·卢因第一次发现这种藻类时称它为一个新种集胞藻Synecocyslis didemni，第2年才改为原绿藻 Prochloron didemni。根据上述形态特征和光合作用色素组成，原绿藻介于蓝藻门和绿藻门之间，美国藻类学家雷文(Lewin)建议在原核生物界中除细菌门和蓝藻门外，新增原绿藻门(Phlorphyt)，这一主张得到很多学者赞同。

原绿藻的发现，对于研究生物进化，特别是从原核生物至真核生物的进化有重要意义。目前，不少人认为，真核绿藻门是由原核的原绿藻演化来的，而真核绿藻普遍被认为是高等陆生植物的祖先，因此，原绿藻的发现把对植物进化的认识推进了一大步，因而有人把原绿藻的发现视作是藻类进化史上的一件大事。