中国农业科学院郑州果树研究所，成立于1960年，前身为中国农业科学院果树研究所郑州分所，主要研究领域为果树（包括苹果、梨、桃等）和瓜类（如西瓜、甜瓜等）。作为国家级科研机构，郑州果树研究所是国家果树瓜类科技创新、成果转化、国际合作和人才培养基地。研究所拥有6个处室、10个研究中心和12个科技平台，拥有600多人，其中在职职工202人。此外，郑州果树研究所还主办3份科技期刊。

1960年3月，中国农业科学院果树研究所郑州分所成立。

1979年3月，该所更名为中国农业科学院郑州果树研究所。

2017年3月，中国农业科学院郑州果树研究所和作物科学研究所与枣庄市山亭区区人民政府科技战略合作框架协议签约仪式在山亭举行。

2018年4月，中国农业科学院郑州果树研究所与井冈山市人民政府在郑州签署《井冈山市发展特色果业巩固脱贫成果合作协议》。

据2018年8月中国农业科学院郑州果树研究所官网显示，研究所拥有600多人，在职职工202人。其中高级职称80人，博士31人、硕士83人。中原学者1人，国家和省部级有突出贡献中青年专家6人，享受国务院政府特殊津贴专家11人，国家现代农业产业技术体系岗位专家10人，中国农业科学院科技创新工程创新团队10个，河南省大宗水果产业技术体系首席专家1人。

据2018年8月中国农业科学院郑州果树研究所官网显示，研究所拥有10个研究中心、12个科技平台，在全中国布局建设10个试验站和100个成果示范基地。

研究中心：果树种质改良研究中心、瓜类种质改良研究中心、果树瓜类栽培研究中心、果树瓜类植保研究中心、果品贮藏加工研究中心、果品质量检测研究中心、果树瓜类信息研究中心、果树脱毒种苗研究中心、园林植物研究发展中心

科技平台：国家葡萄桃种质资源圃、国家西瓜甜瓜中期库、国家农作物种质资源平台瓜果子平台、国家瓜果改良中心、国家猕猴桃科技创新联盟、农业部果树育种技术重点实验室、农业部果品及苗木质量监督检验测试中心、河南省果树瓜类生物学重点实验室、国家外专局引智示范推广基地、中原地区新西兰果树科学联合实验室、中国-西班牙果树科学与技术联合实验室、中国-保加利亚果树生物学联合实验室

截至2017年10月，研究所实验室现占地面积约1300㎡，科研仪器资产总值6700余万元，其中20万元以上大型仪器60余台（套），价值3100余万元。

据2018年8月中国农业科学院郑州果树研究所官网显示，研究所共取得各类科研成果207项，其中10项成果获国家级科技奖励，95项成果获得省部级奖励，培育并通过省级以上审定的果树瓜类新品种209个，其中国审（鉴）品种38个。

2017年研究所获省部级奖励6项；审定新品种24个，增长20%；获新品种权14项，增长100%；获专利17项，增长55%；发表论文122篇，其中SCI论文增长53%，高影响因子（IF>3）论文9篇；出版著作20部；获软件著作权39项。

据2018年8月中国农业科学院郑州果树研究所官网显示，研究所主办《果树学报》《中国瓜菜》和《果农之友》3份科技期刊。

《果树学报》被CA化学文摘（美）（2014）、JST日本科学技术振兴机构数据库（日）（2013）、Pж（AJ）文摘杂志（俄）（2014）、CSCD中国科学引文数据库（2017-2018年度）（含扩展版）、北京大学《核心期刊目录》（1992年（第一版），1996年（第二版），2000年版，2004年版，2008年版，2011年版，2014年版）等收录。

《中国瓜菜》被美国《化学文摘》（CA）（2014）、北京大学《中文核心期刊要目总览》（2014年版）、中国科技论文与引文数据库（CSTPCD）等收录。

《果农之友》主要介绍果树瓜类科研成果、新品种、新技术，普及果树瓜类栽培技术、病虫纺织和贮藏保险、果品深加工等科技知识，提供果品销售渠道和信息。

据2018年8月中国农业科学院郑州果树研究所官网显示，研究所有4个博士学位授权二级学科，2个硕士学位授权二级学科。

硕士学术学位授权二级学科：农产品加工及贮藏工程、食品科学

博士学术学位授权二级学科：果树学、蔬菜学、植物病理学、农业昆虫与害虫防治

2016年研究所研究生新招收学生15人（含留学生1人），在读学生共计46人，其中博士19人；新增博导1人，硕导4人，共计34位导师（含8位博导）。

2016届研究所毕业生共计发表论文19篇，其中SCI论文3篇，单篇最高影响因子5.526；研究生获得中期考核优秀奖3人，优秀学生干部4人，社会活动优秀奖2人，陶氏益农勤学奖1人。在研究生院组织的科研记录抽查中，获得优秀评价。

中国农业科学院郑州市果树研究所所徽整体是以绿色为主色调的圆形图案，圆内有研究所中文名和中国农业科学院英文名缩写字母“CAAS”、树苗、郑州拼音首字母“Z”等。

“三有”作风：“凡事有交代、件件有着落、事事有回音”

“四敢四千”精神：“敢与强的比、敢向高的攀、敢同大的争、敢跟快的赛”和“说尽千言万语、走遍千山万水、想尽千方百计、历尽千辛万苦”