新落成的南沙客运站是个公交、长途客运一体化的公路客运站场，也是目前
南沙区唯一的长途汽车客运站场。除360路、361路、364路等9条南沙区内的公交线路外，它每天还会开行前往
广州市市汽车站、番禺客运站、番禺市桥汽车站、洛溪新城公交站以及番禺大岗公交站等广州区域内公交线路。原先位于南沙区江南路上的南沙汽车站，则将在新的南沙客运站投入使用后，从今日起停止运行。
2009年4月22日，南沙汽车客运站在南沙区虎门大桥联络道靠近港前大道的位置正式投入使用，广州市交委和南沙区政府联合举行了开业庆典仪式。与此同时，它还在首批开通南沙前往东莞太平、深圳龙华、
宝安区、
龙岗区，粤西的
罗定市、
怀集县、
高州市，以及广西南宁、
衡阳市、江西萍乡、重庆开县、贵州正安以及
洛阳市和
南阳市等省内外46条长途客运班线，覆盖
广东省周边5个省（自治区、
直辖市），线路最远的达到
河南省。南沙客运站有关负责人表示，今后，他们还将根据客流情况的发展，陆续申请开行更多的客运班线。原先位于
南沙区江南路上的南沙汽车站，则将在新的南沙客运站投入使用后，从今日起停止运行。25日起，原“天河公交场-
南沙天后宫”、“天河公交场-
龙穴岛中船基地”两条公交线路合并为1条南沙旅游专线，合并后仍途经天河公交场和龙穴岛中船基地。