连申线航道作为江苏省第二条“京杭大运河”，按国家三级标准整治，南通段工程2011年4月正式开工，目前，整个工程已完成超过70%，预计2014年上半年建成通航。

作为长三角高等级航道网规划和全国内河航道与港口布局规划确定的高等级航道，连申线沟通连云港港、大丰港、洋口港、如皋港等沿海、沿江港口，因此有着第二条“京杭大运河”之称，也被称为沿海“水上高速”。

以长江为界分为江南、江北段，连申线纵贯江苏东部。目前，江北段航道等级较低，航运条件较差，除部分航段外，其余均低于五级标准。整治工程将按三级航道标准展开，设计最大船舶等级为1000吨级。

苏北段：盐河(含新墟运河) ～灌河～射阳河～通榆河～通扬运河～如泰运河～焦港河

连申线长江以北段全长375公里，其中东台市至连云港市段随着盐灌船闸的建成通航、连云港港疏港航道工程交工验收，已经实现通航。

连申线东台至长江段航道交工通航。2013年12月18日，6艘千吨级运输船在航政艇的引导下，顺利通过海安双线船闸，标志着有着“第二条京杭大运河”之称的连申线东台至长江段航道整治工程正式交工通航。

连申线是我省“十二五”交通重点工程，北起连云港，经盐城市、南通市、苏州市，止于上海市，全长558公里。为构建沟通我省南北的“水上主动脉”，我省决定对连申线全线按三级航道标准进行分期整治，其中东台市至长江段航道里程92公里，总投资46亿元，整治内容包括新建海安市双线大型船闸1座，新建航道护岸123公里，改建桥梁39座，新建东台、海安、如皋服务区等。工程从2011年7月开工，历经2年6个月的建设。通过这条水上“高速公路”，1000吨级大吨位船舶可直接进入内河，内河运输进入“万吨级”时代。工程建成后，将最大限度地实现连申线北经连云港港直通黄海，南经南通市直达长江，从而在江苏沿海地区建成一条通航千吨级船舶的南北水运主通道。

参加交工验收的省交通运输厅质监局专家汤渭清表示，连申线东台至长江段航道率先建成后，将与全省干线航道网做到整体衔接和协调发展，航道通航能力将由改造前的300吨船舶提升到千吨船，年货物通过量将达到5000万吨以上。这不仅可以为沿海产业带的形成和发展提供运输保障，而且为沟通沿海、沿江港口提供便捷的集疏运通道，对促进地区经济发展、水资源的开发和综合利用等具有十分重要的意义。

苏南段：申张线～苏中内港线