也叫灰胞藻（Glaucocystophytes）或者灰囊体（Glaucocystids）。植物的光合作用细胞器统称质体（plastids），被认为是由蓝菌门同原始的真核生物细胞内共生起源的。 a），并且同蓝细菌和红藻一样，通过藻胆体（phycobilisomes）收集光能。

灰藻门（Glaucophyta)：

灰藻（Glaucophytes), 也叫灰胞藻（Glaucocystophytes）或者灰囊体（Glaucocystids）。是一小类淡水真核微藻。由于在进化上的特殊地位，它在分类学上得以和红藻、绿藻门、维管植物并列。独特的光合作用细胞器是这一类群的最显著的特征。进化上，认为绿色植物（绿藻和高等植物）和红藻有共同的藻类祖先，灰藻与这一祖先类似，因而在叶绿体起源领域得到了生物学家的关注。

灰藻的光合作用细胞器被称做蓝小体（cyanelles）。

植物的光合作用细胞器统称质体（plastids），被认为是由蓝菌门同原始的真核生物细胞内共生起源的。和其他植物的质体不同，蓝小体含有肽聚糖层，被认为蓝细菌内共生过程中的遗留。在捕光色素方面，灰藻含有叶绿素a (chlorophyll a），并且同蓝细菌和红藻一样，通过藻胆体（phycobilisomes）收集光能。而绿藻门和维管植物中，已经不存在藻胆体。

灰藻的线粒体的嵴比较宽，在没有中心粒（centrioles）的情况下进行开放式有丝分裂（mitosis）。可运动的种类中，含两条不等的鞭毛，鞭毛上有细丝并通过多层的微管结构锚定，这些和某些绿藻中的鞭毛类型一致。

目前已知的灰藻只有13种，均不常见，分种三个属：

灰囊藻属（Glaucocystis）有细胞壁，和退化的鞭毛，不能运动。

蓝载藻属（Cyanophora）没细胞壁，能运动

粘毛藻属（Gloeochaete）有运动期和不动期，有细胞壁，似乎不是纤维素组成