两型小叉丝壳（学名：Microsphaera berberidis var. dimorpha）是一种真菌植物，属于白粉菌目白粉菌科叉丝壳属，主要寄生在小檗属植物上。该种真菌的菌丝体叶两面生长，主要生长在叶表，有时会消失或存留，展生。子囊果散生或由聚生到散生，形状为球形或扁球形。

两型小檗叉丝壳的菌丝体叶的两面生，主要生叶表，消失或存留，展生。子囊果散生，或由聚生到散生，球形或扁球形，直径在67-123微米之间，多为76-90微米。子囊果的壁细胞大小为12-15×10-13微米。子囊果的附属丝有5-17根，常为9-12根，长72-156微米，为子囊果直径的0.9-2.2倍，常为1.5倍左右。子囊2-6个，形状为卵形、椭圆形或不规则形，壁厚，无柄或具短柄。子囊孢子2-7个，常为4个，形状为椭圆形或长椭圆形。

两型小檗叉丝壳主要分布在中国新疆巩留地区，寄生在蓝果小檗（Berberis heteropoda Schrenk）上。

两型小檗叉丝壳与原变种的主要区别在于它附属丝的末枝有一部分反卷，分枝较紧密，子囊数目较少。本变种与Microsphaera berberidicola Tai在形态上也有某些相似之处，其主要区别在于前者的子囊果较大，附属丝较短及子囊抱子数目不同等。Braun（1983c）主张将本变种提升为种。