北京大学医学出版社成立于1989年8月，是中央级专业出版社，也是教育部直属的重点大学出版社。

北京大学医学出版社(Peking University Medical Press)成立于1989年8月，是中央级专业出版社，也是教育部直属的重点大学出版社。前身为北京大学医学部、北京协和医学院－清华大学医学部联合出版社。

1999年3月独立建社，更名为北京医科大学出版社。

2002年8月经新闻出版总署批准，更名为北京大学医学出版社。

北京大学医学出版社设有如下几个部门：办公室、总编室、一编室、二编室、三编室、四编室、综合编辑室、电子出版编辑室、国际合作部、ELESIVER编室、审读质检室、出版部、市场部、营销部、财务部、读者服务部、书库、网上书店。

北京大学医学出版社出版图书范围包括医药卫生教材及辅导书、医学专著、译著、工具书、图谱及科普读物。

北医出版社专注于医学专业出版，打造教材、学术精品，数百种图书入选国家级规划教材，多种图书获全国优秀教材奖、中国国家图书奖、中华优秀出版物奖、“三个一百”原创工程、国家出版基金等重要奖项或资助。

北京大学医学出版社建社以来，共出版医学图书2000余种，发行1800余万册。

近70余种图书获部、委以上奖，其中《血管生物学》《消化系统疾病电子内镜图谱》获“中国图书奖”，《科学防治 战胜非典》获第六届国家图书奖特别奖，《泌尿外科内镜诊断治疗学》获中华优秀出版物（图书）奖。被国家教育部确立为“先进高校出版社”；曾经三次被国家新闻出版总署评为“全国良好出版社”；三次被国家卫生部评为“杰出科技著作突出贡献出版社”。

2023年6月，位列中国大陆出版机构入藏品种排行榜第99位。

北京大学医学出版社建社以来，始终坚持为社会主义服务，以为人民健康事业服务，为医学教育、科研和医疗卫生服务为办社宗旨，以“高质量、高品位、高水平、多层次”的品牌理念，成为社会信誉度很高的大学出版社，赢得了作者、读者以及出版界业内的认可。