第3届台湾电影金马奖于1965年10月27日至10月30日在台北市举行，由中国台湾电影事业发展基金会的台北金马影展执行委员会主办。该届共有16部影片获奖，其中李行导演的《养鸭人家》获得香港电影金像奖最佳电影奖，李行凭此片获得最佳导演奖，葛香亭凭此片获得最佳男主角奖，李丽华凭借《故都春梦》获得最佳女主角奖。颁奖典礼于1965年10月30日在台湾省举行。

注：第一届至第十五届，金马奖仅公布得奖名单，因此无“入围名单”资料。

最佳剧情《养鸭人家》(中国电影出品)

优等剧情片--《深宫怨》(电公司出品)

《人之初》(电懋公司出品)

《血溅牡丹红》(邵氏兄弟出品)

优等纪录片《石门水库》(台制厂出品)

《武昌演习》(中国电影制片厂出品)

获奖助金影片--《八十八号情报员》(华明公司出品)

《最后的裁判》(中兴通讯出品)

最佳导演--李行《养鸭人家》

最佳男主角--葛香亭《养鸭人家》

最佳女主角--李丽华《故都春梦》

最佳男配角--井渺《故都春梦》

最佳女配角--王莱《人之初》

最佳童星--小龙《最后的裁判》

最佳编剧--江榴照《谋海四壮士》

最佳彩色摄影--赖成英《养鸭人家》

最佳黑白摄影--王剑寒《一毛钱》

最佳剪辑--王朝曦《深宫怨》

最佳彩色美术设计曹年龙《状元及第》

最佳音乐顾嘉辉《万花迎春》

骆明道《情人石》

最佳录音--孙冰韵《深宫怨》

最佳纪录片策划--郝和熙《春江花月夜》

端木姓火宣

最佳艺术设计特别奖--《春江花月夜》(台制厂出品)

最佳发扬民族精神特别奖--《谋海四壮士》(国际电影懋业公司出品)