中国音乐学院音乐学系成立于1981年，其前身为北京艺术学院乐理学科。目前，音乐学系设有民族音乐和音乐史两个教研室。

音乐学系拥有一支高素质的教学队伍，全体教师均持有硕士学位，其中包括6名博士、1名双硕士以及1名国家级有突出贡献专家。此外，还有3位教师荣获国家“区永熙优秀音乐教育奖”。2005年，音乐学系民族音乐教学项目荣获北京市优秀教学成果一等奖，民族音乐教研室被评为“人才强教”学术创新团队。次年，一名教师获得“拔尖人才”荣誉称号。

音乐学系致力于培养具备马克思主义基本理论素养和系统专业知识的学生，使其能够掌握一定的音乐实践技能和教学能力。这些学生未来能够在高等院校、文化艺术机构、研究单位、出版社、广播电视媒体等领域从事教学、研究、编辑、评论和管理工作。

自成立以来，音乐学系已经培养出114名本科生和27名研究生。其中，有6名毕业生继续在国内外高校深造并取得博士学位。这些毕业生逐渐成为了各自领域的骨干力量。

音乐学系本科生的专业核心课程涵盖汉族民俗音乐、嘻哈音乐、戏曲音乐、民族器乐、少数民族民歌、世界民族民间音乐、民族音乐学概论、采风技能、中国古代音乐史、中国近现代音乐史、西方音乐史、音乐美学、古代乐论等多个领域。除了本专业的必修课程外，音乐学系还负责全校范围内的音乐学相关公共课程，并提供超过20门的选修课程供学生选择。