该片拍摄于建党90周年之际，讲述了伟大的
抗日战争年代里，在我党领导的抗日根据地，以张根生为代表的抗日儿童团员们协助
八路军宣传抗日、侦察敌情、站岗放哨，甚至执行任务保家卫国的故事。南尼苏，根生的爷爷、宏宝的外公、儿童团的伙伴们……一一倒在了敌人残忍的枪口下。
1942年，在
河北省行河县河岔村就有这样一个儿童组织，小根生的爷爷是苏维埃农协会长、爸爸是八路军的团长、妈妈在军医院，从小根生就受到周围人的影响，立志要保家卫国、打日本鬼子，根生担任村里儿童团的团长，和妹妹珍珍、郭妮、麻雀、小荣等伙伴们一起在村口站岗放哨，用他们自己的行动为乡亲和
区小队做力所能及的事情。一天，根生从区小队李叔叔和爷爷的对话里知道，一名在
关东军做卧底的女
八路军同志被日本鬼子追落鹰嘴潭悬崖，下落不明，便自告奋勇要进山去找那位女同志。根生带着小伙伴宏宝两人进了鹰潭沟，同时日本鬼子小野中佐带着一队日本兵也进入了鹰潭沟。根生带着宏宝终于抢在日本人之前找到了受伤
昏迷的女共产党南尼苏，他们一边躲避日本人的围追堵截，一边想办法与
武工队的汇合，还要救治南尼苏流血不止的伤。同时，儿童团的其他成员们，也在协助武工队阻止敌人的追捕，寻找根生和南尼苏……为了掩护根生和
回顾我国近代革命史，中华民族之所以能够战胜外有强敌入侵、内有封建压迫的生存危难，历经艰辛先后实现民族独立、人民解放，建立
社会主义新中国，拥有了今天全民基本小康的美好生活，是无数革命先烈用鲜血和生命换来的。我们的泪水是悲悯的，而不由仇恨产生的。我们的伤痛是永远的，不是用仇恨能解决的。以人类灾难作为民族前进的警世钟比任何道理都要来得更加直观强烈。
中国抗日战争，团结和教育了全国人民，同时也培养了新一代中国的小主人。全国广大少年儿童在党的领导下，为抗战胜利作出了不可磨灭的贡献，出现了许多可歌可泣的英勇斗争事迹，涌现了一大批值得永远怀念和歌颂的少年英雄，小根生们利用自己年纪小，不被注意，不受敌人的威逼利诱，利用地势地形同敌人斗智斗勇，英勇无畏的完成组织交代的任务，成功的帮助
八路军和
武工队消灭了敌人，为行河县的抗日历史涂抹下鲜艳壮丽的一笔。
自强才能自救，勇敢地面对曾经的伤痛才能更加勇敢地走下去。少年儿童是祖国为未来，少年强则国强，少年智则国智。电影《抗日儿童团》希望通过这样深刻、感动、热血的历史再现，向世界展示那个艰苦的年代全中国上到80老人下到10来岁孩童对祖国的热爱、对家园的守护、对正义的拥护，向社会展示以片中主人公为代表的青少年智勇双全、面对生死、面对侵略者的无畏无惧，给予当代的儿童和青少年一番爱国情怀和社会责任感的教育和洗礼。