该剧讲述的是
八路军战士周汉如何从抗日战争、
解放战争中成长为一名共和国将军，前后六十年所经历的风风雨雨，以及与他的战友黄振中之间的恩怨情仇。
抗战时期，八路军警卫排长周汉娃和侦察排长魏油娃一起护送英雄团团长去结婚，新婚之夜却被可恶的小鬼子搅了局。团长怀着遗憾带领大家连夜赶回部队，路上不料与敌人遭遇，团长身负重伤。为了不拖累战友，更无法面对新婚却未圆房的妻子，团长举枪自尽。为了部队的荣誉和士气，魏油娃主动承担起全部责任，含泪离开了自己热爱的部队。周汉娃以为油娃子被处决受到巨大震动，并因此对在这起事件中起到关键作用的黄振中极为不满。
英勇善战的周汉娃因屡建军功被提升为营长并改名叫周汉，政委李冶夫派黄振中给他做指导员。声称就是要让黄振中别住周汉的“直肠子”。黄振中爱上了投奔革命部队的
北平市女学生肖萍，但落花有意、流水无情，肖萍心有所属的那个人却是周汉。然而，命运弄人，周汉挑了他认为能生娃的
山东省支前模范于恩华为妻，心碎的肖萍最终嫁给了黄振中。于恩
华为周汉生了一个女儿、三个儿子，肖萍为黄振中只生了一个女儿。
周汉和黄振中就像一对冤家，在争争吵吵中并肩奋战，一起迎来了新中国，一起成长为共和国将军。但周汉的心里却始终有一个解不开的结——那就是好战友魏油娃的“冤死”。孩子们长大了，周汉的二儿子周东进与已是鞋匠的魏油娃的儿子魏铭坤同时被周汉送到了部队。魏铭坤要求与黄振中的女儿黄妮娜建立友谊，却被妮娜拒绝，因为她心里喜欢的是周东进。东进与铭坤率领各自的连队参加军事演习，东进由于指挥失误，让铭坤占了上风。东进拒绝接受授予他的三等功，让部队领导十分尴尬，并因此失去了晋升的机会。妮娜埋怨东进不给她争气，东进一气之下断绝了与妮娜的恋爱关系。黄振中为了安慰女儿，私下里帮助妮娜挑选男友，选中了魏铭坤。妮娜为了报复东进，答应与铭坤结婚。东进被调离
野战部队，铭坤却快速晋升当上了团长。
东进的大哥周南征与李冶夫的小女儿李小京结婚，妮娜与铭坤的婚礼也同时举行。铭坤婚后被调到部队机关重用，但与妮娜的关系却极不和谐，两人最终以离婚收场。妮娜后来转业到地方上工作，女儿了了出事的时候，东进向妮娜伸出了援助之手。东进回家看望病危的父亲周汉，自己的部队却在这时发生了两件大事。一是哨所出了“伤亡事件”；二是自己的老对头铭坤当上了他的顶头上司——军分区司令。
团政委王耀文在东进的哥哥、
省军区组织部长周南征和分区司令魏铭坤的默许下，成功地把哨所“伤亡事件”描述为一场英雄事迹。东进在了解了事情的真相后陷入两难境地。老将军周汉逝世，东进在父亲精神的激励下毅然向上级说出了事件的真相。
《
亮剑》走红后，有一批军旅题材的电视剧问世，荧屏上也涌现出一批“一根筋”式的草莽英雄。最早起步于
孙海英在《
激情燃烧的岁月》中扮演的
石光荣，后来又有了红色经典《
林海雪原》中的
杨子荣和《
铁道游击队》中的刘洪，以及李幼傧在《亮剑》中扮演的
李云龙。唯有近期正在
广东省、北京4台等各个卫视及地方电视台反复热播的《将门风云》中，
郑晓宁扮演的政委李冶夫另辟蹊径，演绎了一个善良、正直、有血有肉的人性化的政委。
由于剧中运用特技手法使母女和父子在一个画面中同时出现，演员们需要与“无实物”交流，只能对着竹竿想像与另一个自己演对手戏，这对于第一次尝试类似特技手法的
田海蓉以及剧组来说，都是不小的挑战。于是在《将门风云》的拍摄中就经常会出现这样的有趣场景：“自己打自己耳光”，“自己给自己擦眼泪”。在外人来看虽然有意思，但对于演员来说，却是一个很大的考验，田海蓉说：“那将近1个月的拍摄期，每天要对着竹竿演戏，只能发挥想象去表演。演完妈妈马上换装演女儿，根本来不及转换思维，有时候就会出现角色错位的情况。我和丁海锋就会互相提醒对方现在的身份，我们都快
精神分裂症了。”不过，
田海蓉表示她和丁海锋都觉得这样的角色和挑战“千年难遇”，演得非常过瘾。
“我太喜欢周汉这个角色了！”丁海峰告诉记者。为了演绎好这个角色，他研读了大量抗日时期的书籍。在拍摄现场，不论任何高危险系数动作，他均坚持上阵。丁海峰对
周汉的儿子周东进的演绎同样形神兼备、个性十足。“相比周汉，我更能了解周东进。”他解释说。据丁海峰回忆在近1个月的拍摄期间，自己每天要对着竹竿演戏，表演完全靠发挥想象。经常演完爸爸马上得换装演儿子，根本来不及转换思维，有时还会出现角色错位的情况。于是只好跟搭档
田海蓉提前说好每次拍摄前都要互相提醒对方当下的身份，搞得两个人都有点精神恍惚。丁海峰坦言还是非常享受这种“精神分裂”的感觉。
一向以温柔妩媚形象示人的著名演员田海蓉在《将门风云》中第一次演起了军人，一人分饰两角，出演
八路军女战士肖萍以及肖萍的女儿黄莉娜，年龄跨度长达60年，对年轻的田海蓉来说可谓是一次不小的挑战。田海蓉回忆道，自己看似只饰演了两个人物，但人物的状态却有五、六个，有时整个人都快崩溃了，甚至在睡梦中也会出现自己饰演的母亲和女儿交流的情景。根据剧情，
田海蓉饰演的肖萍是一位漂亮聪慧的女八路军战士，深得周汉（
丁海峰饰）和黄振中（谭阳饰）两个男人的喜欢，尽管肖萍一直中意军事上有勇有谋但是对感情却摸不着头脑的周汉，但是却经不住黄振中的强势追求，最终嫁给了黄振中。在这部“男人戏”里面，田海蓉这样一位漂亮的
八路军女战士自然是“万绿丛中一点红”，可谓是该剧的一大亮点。
该剧以两代军人的情感纠葛为主线，以不同时代的军人生活为背景，全景式的展现了两代军人在爱情、事业和生活中的悲欢离合，反映了他们面对荣誉、牺牲、事业和爱情所表现出来的真实而又可歌可泣的精神风貌。（
新浪娱乐评）
该剧描写了以
周汉的儿子周东进为代表的新一代军人形象。剧中的战友情、父子情和爱情相互交织，情节直指人心。（《
成都日报》评）