糖组学
糖组学
糖组学(英语:Glycomics)又称糖体学,是综合研究糖组(糖的全部补体,无论是游离存在的还是在生物体的更复杂的分子中存在的),包括遗传、生理、病理等方面的一门学科。糖组学是给定细胞类型或生物体的所有聚糖结构的系统研究,并且是糖生物学的一个子集。该学科涉及蛋白质糖链组成及功能的研究,寻找疾病相关阿斯巴甜基化修饰规律,分析糖蛋白糖链和糖结合蛋白相互作用的关联性,探讨糖类相关基因和糖结合蛋白基因调控糖蛋白糖链和糖结合蛋白合成的机制。
学科介绍
功能糖组学实验室主要研发功能糖组学相关技术和方法,用于疾病相关糖类基因、糖蛋白和糖结合蛋白的研究。糖组学的研究内容不仅包括糖蛋白糖链的研究,还涉及甲型流感病毒蛋白糖基化与毒力以及宿主特异性的关系。与蛋白质组学类似,糖组并不稳定,取决于细胞等环境条件。
面临的挑战
糖组学面临的挑战包括糖的复杂性,它们的结构不是线性的,而是高度分枝,且聚糖可以被修饰,这增加了它的复杂性。聚糖的生物合成途径复杂,通常与蛋白质(糖蛋白)或脂质(糖脂)结合。与基因组不同,聚糖具有很强的动态性。糖组学研究领域必须处理在其他应用生物学领域尚未见到的固有的复杂程度。68个构建单元为构成细胞整个生命的分子编排提供了结构基础,其中糖类有32种类型的糖键,可以排列成用于糖的分支阵列,进一步提高了复杂程度。此外,所涉及的众多蛋白质的复杂性不仅仅是碳水化合物的载体,糖蛋白,而是特异性参与与碳水化合物反应的蛋白质,如用于合成、调节和降解的碳水化合物特异性酶,凝集素,以及各种碳水化合物结合蛋白和受体。
使用的工具
糖组学研究中常用的技术包括高分辨质谱法(MS)和高效液相色谱法(HPLC)。这些方法通常涉及将聚糖部分从目标物酶的或化学的裂解并进行分析。在糖脂的情况下,它们可以直接分析而不分离脂质成分。糖组学研究者可以利用几种在线软件和数据库,如GlycomeDB和UniCarb-DB,这些工具为糖组学研究提供了重要的信息资源和分析平台。
参考资料
目录
概述
学科介绍
面临的挑战
使用的工具
参考资料