郑士元（生卒年不详），又称郑士原，字好仁，明初筒车（今宁海县）人，官至湖广按察使事。

郑士元于洪武四年（1371年）中进士，曾任六品监察御史，后升为湖广按察使佥事，为官刚正廉洁，行事一丝不苟。他曾向朱元璋直言进谏：“凡为官者，须刚正廉洁。清贫，士之常也。”他参与过遏制荆、襄卒抢劫民女的事件，并对抗御史台讞上的冤情。后因空印案连坐而下狱，因其弟郑士利上言解释空印案，郑士元得以从流刑地返回。

郑士元是洪武四年（1371年）中的进士，在明太祖时，他做过六品监察御史。

郑士元任期中，纠弹了不少贪官污吏，其中包括皇侄朱桓的重大集体贪污案件。

朱元璋因朱桓的父亲曾救过他的命，有意免去朱桓的死罪。然而，郑士元坚持原则，认为朱桓屡次犯罪，若不加以惩处，就应制定特别法律以宽待皇亲国戚。朱元璋因此大怒，欲将郑士元处以死罪。但郑士元毫无畏惧，准备坦然面对死亡，连刽子手都被他的勇气所感动。

太子朱标后来引用了李世民采纳魏徵建议和曹操宽待陈琳的故事，为郑士元求情。朱元璋最终被说服，下令处死朱桓以示警戒，并对郑士元表示赞赏。朱元璋询问郑士元为何能在贫困中坚守原则，面对威胁也不屈服。郑士元回答说，官员的一言一行都代表着朝廷，清廉则百姓称赞国家正直，若官员不敢镇压邪恶，国家将失去民心。他强调自己不敢亵渎职守，唯恐辜负朝廷的重托。

朱元璋对郑士元的刚正廉洁大为赞赏，认为官员应以清贫为常态，节俭养德，奢侈则会引诱贪婪。他指出，那些见财起意的人不适合做官，而郑士元不仅清廉正直，还勇于提出建议和赞扬善行。因此，朱元璋决定提升郑士元为湖广按察使司佥事，正五品官职。

后来郑士元一直忙于公务，其妻罹患重病来函，才得以回家探视，但家里实在太穷，不但没钱给妻治病，甚至于妻死后，也无钱为之安葬，他的五个儿子竟央求卖身葬母。最后还是同僚亲友筹钱，才得以办好后事。出殡时，民众夹道送葬，那时正下大雨，民众竟没一人散去。