医院发挥中医针灸特色，突出专科优势，开展多项原汁原味的传统中医药技术。针灸二科（腰椎病科）突出名老中医“对药”“对穴”治疗手段；针灸三科（关节病科）以突出山西省特色针灸疗法“新九针”的应用。

山西省针灸研究所始建于1984年，由山西针灸泰斗、新九针发明者师怀堂教授创立；2012年通过国家中医药管理局“三甲”评审，成为全国首家三级甲等针灸专科医院；2013年增名山西省针灸医院。医院设有一个国家级重点实验室（针灸针法实验室），两个国家级重点学科（针灸学、康复学），两个国家级重点专科（针灸科、脑病科）。山西省五个省级专科（专病）（针灸科、脑病科、康复科、关节病科、颈椎病）。