该剧分为《少年英雄方世玉之英雄出少年》和《少年英雄方世玉之少林起风云》两个部分，主要讲述了少年方世玉在母亲
苗翠花的调教下练就一身铜皮铁骨，经常在外打抱不平、行侠仗义，因此结识了
洪熙官等一众好友，最终众人合力打败武林魔头
白眉道长拯救武林的英雄故事。
方世玉（
张卫健 饰）在母亲苗翠花（
恬妞 饰）悉心调教下，不单以药酒洗练根骨，练就了一身铜皮铁骨，更被母亲传以少林武功，这让生性调皮的方世玉更是横行无忌。苗翠花平时不仅不教方世玉低调做人，甚至还与其一起行侠仗义。方世玉的父亲方德（
张振寰 饰）为了约束儿子，决定让其去通天书院读书。但通天书院是贵族官宦子弟的聚集处，方德无权无势，因此让方世玉在考试中落榜。之后方世玉入读琼花书院，与
洪熙官（
樊少皇饰）和胡惠乾（
郑国霖饰）等人不打不相识，更是成了知己好友。在联院武技比试大赛当天，
杭州市的官宦小姐
严咏春（
李婷宜饰）带着她的一群好姐妹到场观战，更是设下赌注，哪家书院取胜，她与众姐妹便到其书院旁听一个月。
方世玉和洪熙官所在的联队击败了通天书院。严咏春之后带着众闺秀前往琼花书院旁听，在长期相处中，严咏春不仅与
苗翠花兴趣相投，成了莫逆之交，还与洪熙官日久生情，两人成为一对恋人。
然而，通天书院的雷老虎（
赵箭 饰）不堪失败，决定与
方世玉等人比试。在比试中，方世玉不慎将对方打死。雷老虎的妻子
李小环（
商天娥 饰）得知丈夫惨死，找到方世玉寻仇，方世玉因不敌对方，被对方打得当场吐血，幸好他身上的
护心镜护住了他的心脉，让其逃过一劫。苗翠花知道对方是李巴山（
李海兴 饰）的女儿，更是武当的白眉道人（
陈鸿烈 饰）的师侄，为了保护
方世玉，苗翠花秘密将其送至少林寺习武，
洪熙官与胡惠乾也跟随前往。在少林寺，方世玉对孤女出生的凌小小（
何美钿 饰）一见钟情，但对方对他的态度若即若离，这让方世玉很为苦恼。时间一天天过去，
方世玉还活着的消息却被李巴山所知，方世玉因在
北少林寺武功精进不少，在李巴山来寻仇时，将其踢下木桩身亡。
不久，
李小环与白眉道人伙同朝廷前来为李巴山报仇，他们不仅火烧少林，杀死无数少林僧人，少林方丈与长老们也全部牺牲，凌小小也被白眉道人擒走。
方世玉眼见自己为少林惹下大祸，悔疚不已，决定带着众人为
南少林寺报仇。方世玉在与白眉道人打斗中，被白眉道人打成重伤当场身亡。
苗翠花听到儿子去世的消息伤心欲绝，在欲将方世玉从坟墓里挖出来时，方世玉却突然从坟里飞出，形同鬼魅。之后他还找到白眉道人，不仅破了对方的
童子功，还将其杀死，但
方世玉却失去了两年记忆。原来，方世玉曾经与众人比武时，已经将对方的武功招式系数记住，还融为一体，这种武功会让人进入假死状态，并失去记忆。可
方世玉在见到凌小小的那一刻，却还记得与她的感情，凌小小在经历这一之后，与方世玉坦诚相待，两人也终成眷属。
因之前有
李连杰版本的方世玉以及
关咏荷版的
苗翠花，对于“老戏再拍”能否获得观众认可，扮演苗翠花的
恬妞称看一个戏是否成功、能否赢得观众青睐，还要看演员能否拍好戏。
演员
郑国霖作为《少年英雄方世玉》主演之一。因郑国霖刚接触演艺行业不久，几乎不会演戏，在他怀疑自己究竟是否适合做这一行时，
张卫健用大实话劝他，想买车、买房就只有好好演绎下去，郑国霖也因此有了奋斗的动力。在拍摄《少年英雄方世玉》时，有一场练功戏，当时拍摄的郑国霖必须泡在河水中，河水非常凉，郑国霖冻得骨头都冷，拍摄完成后赶紧趴在岸边暴晒着的鹅卵石上取暖。郑国霖还一不小心踩到岸边十分锋利的岩石上，把左脚脚刮伤。
演员
恬妞说她在拍摄前从没有看过有关
苗翠花和
方世玉的电影，这种性格的角色又是她从前从未接触过的。她称自己和张卫健的这次合作非常愉快，两个人在演戏过程中碰撞可以用“撞得鼻青脸肿”来形容。
《少年英雄方世玉》江湖故事颇具现代感，全剧风格轻松谐趣、清新而富有活力。恬妞和
张卫健饰演的苗翠花和方世玉具有前卫、现代以及生活化的特质。
《少年英雄方世玉》于1999年8月在香港
亚洲电视首播后，收视率创下亚视历史最高纪录，并超过了当时最火的《
还珠格格》，同年9月在
台湾省播出后，在收视排行榜上居高不下。在1999年11月，收视率一直稳居排行榜首位。2009年3月3日在重庆卫视播出后，获得较高收视率，2012年3月在
东南卫视重播后，收视率又创新高。
《少年英雄方世玉》剧情不同于其他影视版本的《方世玉》，演员
恬妞与
张卫健搭档饰演的
苗翠花与方世玉母子俩，既有普通母子一样互相爱护，又有像兄弟姐妹一样一起玩闹搞笑，两位演员的表演不仅令电视剧风格轻松谐趣，还清新而富有活力。（
新浪娱乐 评）
张卫健饰演的
方世玉古怪精灵，恬记饰演的苗翠花傻里傻气，让观众过了把眼瘾，片中正义与邪恶的较量，以及戏剧化的冲突，获得了观众的关注。张卫健的本色出演了方世玉，将人物的古灵精怪演绎了出来。李婷的“咏春”很适合其天然气质。
何美钿扮演的“小小”，被观众评像“ 小刘蓓”，也因此获得大家认可。剧中“儿女情长”的情节也具有笑料。（北方晚报 评）
《少年英雄方世玉》比起以往同类题材的电影电视作品，实际上仍是“旧瓶新酒”“老戏重炒”，尽管《少年英雄方世玉》仍然讲的是方世玉打雷老虎、除
白眉恶道的故事，然而戏中却采用了最前卫的手法，句中有“哇塞”、“好酷”之类的流行语。
方世玉对其父母方德、
苗翠花的称呼都改用了“德哥”、“翠姐”。此戏在
香港特别行政区播出后，好多小孩因学方世被父母打。（北方晚报 评）