张乃翥是中国魏晋南北朝史、隋唐史、丝绸之路文化、中西文化交流、石窟寺研究方面的著名专家，在国内外有着重要影响，曾应邀赴
新加坡、
韩国、
意大利、
奥地利、
俄罗斯进行国际学术交流和讲学，并访问
印度及
欧洲诸国的众多
文化遗产和博物馆。
张乃翥在龙门工作期间，注重科研工作的发展，勤于科研，热心指导青年后学，在石窟研究、成果出版、人员培养、龙门石窟文化艺术的传承弘扬等方面作出了重要贡献,发表论文100多篇，出版《龙门石窟佛教造像》《
龙门石窟与西域文明》《洛阳与丝绸之路》《
龙门区系石刻文萃》《龙门佛教寺院史料辑绎》《佛教石窟与丝绸之路》《丝绸之路视域中的洛阳石刻》等学术论著10多部。
张乃翥自2006年退休以后，仍然关心、支持龙门石窟的保护研究事业，依然笔耕不辍进行深入研究，发表《龙门石窟北朝造像中装饰雕刻的艺术格调》《文物视域下的西晋洛阳与西域地区的文化交流》《从魏晋南北朝时期东西方社会交流看中华民族共同体的历史形成》《龙门地区出土文物与丝绸之路上的人文交流》等论文近30篇。