台湾省行政长官公署(简称行政长官公署、长官公署、省署)是成立于第二次世界大战后，中华民国国民政府用来接收与统治台湾的"特别行政组织"。

台湾省行政长官公署（简称行政长官公署、长官公署、省署）是成立于第二次世界大战后，中华民国国民政府用来接收与统治台湾的“特别行政组织”。于1945年9月1日正式成立的这公署，只维持短短的不到两年寿命。不过在此短暂统治台湾期间，台湾省行政长官公署还经历了影响台湾后世甚巨的“二·二八事件”。1947年二二八事件爆发，有鉴于台湾多数本省人对陈仪为行政长官的长官公署强烈不满，4月22日，国民政府废长官公署，改为台湾省政府。

1943年开罗会议中，反法西斯同盟确定

战后台湾归还中华民国。1944年4月在重庆的中华民国政府，委由中央设计局设立“台湾调查委员会”，并任命陈仪为主任委员。该调查委员会对当时日据下台湾的经济、政治、民生、军事等各方面作出颇为详细的调查。

战后，设于重庆的国民政府对于如何接管台湾有两派意见，一派建议完全与进驻其他“沦陷区”相同，设立“台湾省”。另一派则主张在台设立拥有军警等特别公权力的“特别行政区”。最后蒋中正先生采纳陈仪《台湾接管计划纲要》中的意见，设立台湾省行政长官公署。就此，接收台湾就由该公署负责，而全部公署行政人员初定为2000名。

1945年8月29日，蒋中正任命陈仪为“台湾省行政长官”。

1945年9月1日，国府在重庆宣布成立“台湾省行政长官公署”与“台湾省警备总司令部”，同时任命陈仪兼任“台湾省警备总司令部”的总司令。

1945年9月20日，国民政府补行发布台湾省行政长官公署组织条例。

1945年9月28日，台湾省行政长官公署成立“前进指挥所”。

1945年10月5日，台湾省行政长官公署先遣人员约80多人搭乘美国军机抵达台湾，并将前进指挥所移至台北市。

1945年10月24日，台湾省行政长官陈仪与长官公署、警备总司令部干部搭乘军机从上海市抵达台北。

1945年10月25日，中国战区台湾省受降典礼于上午十点于台北公会堂（今中山堂）举行。降方为大日本帝国所属第十方面军，而陈仪则代表盟军太平洋战区最高统帅受降。同日，台湾省行政长官公署正式运作，机关处所设于原台北市役所（即现在“行政院”院址），取代日本台湾总督府成为台湾最高行政机关。

1946年2月20日，行政长官公署对原台湾总督府完成台湾省军事交接。

1947年2月28日，全台发生动乱，史称二·二八事件。

1947年4月22日，行政院会议决定撤销台湾省行政长官公署，改组为台湾省政府。

1947年5月16日，废除撤销台湾省行政长官公署，正式成立台湾省政府，首任主席为魏道明。

行政长官公署系属一种暂时性组织，目的在接管台湾时，求得事权统一，接收完整。因此，其组织沿习原有日本台湾总督府旧有官署组织之处甚多。其行政公署，除设行政长官外，还有民政处，教育处，会计处，工矿处，农林处，交通处，及台湾省立烟酒公卖局，台湾省立法院等相关组织。

由于台湾光复初期的行政长官公署权力过大，类似日据时期的台湾总督府，因此部份台湾人戏称长官公署为新总督府。