广西文物保护与考古研究所位于广西壮族自治区南宁市，是广西唯一同时具有考古发掘单位资质和可移动文物修复资质的文物机构，也是广西壮族自治区唯一具有中国文物局认定团体考古发觉资格、文物保护工程勘察设计乙级资质等级单位。其前身是1973年成立的广西壮族自治区文物工作队，现任所长是林强。

广西文物保护与考古研究所承担全区文物考古、文物保护、科学研究、考古成果展示等工作。核定编制45名，现有研究馆员13名、副研究馆员3人。2006年，广西壮族自治区文物工作队更名为广西文物考古研究所。2012年，经广西壮族自治区编制委员会批准成立为相当正处级财政全额拨款事业单位。2013年至2014年，广西文物保护与考古研究所对高岭坡遗址进行了考古发掘。2017年，广西文物保护与考古研究所等单位组织对武宣县“勒马汉城遗址”进行考古调查和发掘等工作。2019年5月，广西文物保护与考古研究所正式公布武宣县“勒马汉城遗址”确认为秦汉时期桂(郁)林郡中留(溜)县故城。2021年6月11日，广西文物保护与考古研究所、合浦汉代文化博物馆在合浦县共同举办“考古广西——广西考古重要发现图片展”首展。2024年4月，柳州市联合广西文物保护与考古研究所、中国社会科学院考古研究所对凤岩遗址进行了为期5个多月的考古发掘，清理出一座距今四万至三万年的墓葬。

1973年，广西文物保护与考古研究所前身广西壮族自治区文物工作队成立。2006年，广西壮族自治区文物工作队更名为广西文物考古研究所。2012年，经广西壮族自治区编制委员会批准成立为相当正处级财政全额拨款事业单位。2013年至2014年，广西文物保护与考古研究所对高岭坡遗址进行了考古发掘，发现旧石器时代和新石器时代的文化堆积，揭露出旧石器时代的石器制造场和用火遗迹，出土不同时期的遗物约900件。2016年6月11日，广西文物保护与考古研究所主办6.11南博文化遗产日活动。

2017年，广西文物保护与考古研究所等单位组织对武宣县“勒马汉城遗址”进行考古调查和发掘等工作，发掘面积约3000平方米。2019年5月，广西文物保护与考古研究所正式公布武宣县“勒马汉城遗址”确认为秦汉时期桂(郁)林郡中留(溜)县故城。2019年10月，由广西文物保护与考古研究所、中山大学两家单位联合组成的考古队入驻，宣告对越州故城遗址的首次正式发掘拉开了序幕。2021年6月11日，为更好地展示广西考古工作成就和考古工作者的风采，广西文物保护与考古研究所、合浦汉代文化博物馆在“文化和自然遗产日”活动期间，在合浦县共同举办“考古广西——广西考古重要发现图片展”首展，以此致敬中国考古百年，向中国共产党建党100周年献礼。同年12月28日，由广西文物保护与考古研究所、来宾市博物馆共同举办的“考古广西——广西考古重要发现图片展”在来宾市博物馆开展，此次“广西考古重要发现图片展”梳理了广西考古60年来的成果，通过展出包括石器时代的遗址、夏商周之后的墓葬遗址中出土的文物，以及建筑遗迹、窑址等真实图片，向公众展示了旧石器时代至明清时期的重要考古发现，充分发挥“让文物说话”的历史价值，激发公众对文化遗产保护与传承的意识。

2022年6月，广西文物保护与考古研究所与复旦大学联合申报的2022年度广西重点研发计划项目《广西石灰岩质石质文物保护关键技术研究与示范——以左江花山岩画为例》（编2021AB43026）获得立项，项目由广西文物保护与考古研究所杨清平担任负责人，复旦大学相关研究计划由文物与博物馆学系教授王金华负责。2023年6月，在广西平果市黎明乡蟠桃村那物屯附近的达洪江水库库区一个半岛上，广西文物保护与考古研究所的考古工作者发现一处战国时期墓葬，并挖掘出铜鼓、铜、玉环、玉等一批文物。2024年3月12日，共青团广西文物保护与考古研究所支部委员会第一次团员大会召开。会议选举产生了第一届团支部委员会。3月27日，广西文物保护与考古研究所党支部到贺州市黄姚镇文洞村村委开展交流座谈。同年4月，柳州市联合广西文物保护与考古研究所、中国社会科学院考古研究所对凤岩遗址进行了为期5个多月的考古发掘，清理出一座距今四万至三万年的墓葬。

核定编制45名，现有研究馆员13名、副研究馆员3人。

承担陆地和水下文物调查、考古勘探、考古发掘与研究工作；承担文物保护、收藏、鉴定及基础性、应用性科学研究工作；承担考古发掘现场和出土文物保护技术科学研究工作；承担考古与文物价值阐释和保护成果展示、宣传、教育及应用工作；承担中外合作考古及文物保护交流工作；承担全区基本建设工程中的考古调查、勘探和发掘等工作。

广西文物保护与考古研究所出版《百色革新桥》《合浦汉晋墓发掘报告2009～2013年度》《最早的农人》《越南考古与历史研究》等40余部著作。

广西文物保护与考古研究所完成了平陆运河、大藤峡等水利枢纽，南宁市至百色市、桂林市至梧州市等高速公路，贵阳至南宁市、南宁至玉林市等高速铁路大量基建所涉及的遗址和墓葬的考古工作，主动开展隆安娅怀洞遗址、桂林甑皮岩遗址、邕宁区顶蛳山贝丘遗址、合浦县大浪古城遗址、合浦望牛岭汉墓、越州故城遗址等遗址的科研发掘项目，取得了重要成果，其中宁顶蛳山遗址、百色革新桥遗址等项目获“全国十大考古新发现”，桂林皮岩遗址、合浦汉墓群获评“中国百年百大考古发现”。承担汉代海上丝绸之路合浦港的考古学研究、左江花山岩画与相关考古遗存的关联性研究等多项国家、自治区级社科基金课题。

2024年4月，广西文物保护与考古研究所向文洞村村委捐赠帮扶款6000元，以完善文洞村基础设施建设，改善人居环境。

2023年1月，广西壮族自治区人民政府发布了广西第十七次社会科学优秀成果获奖名单。广西文物保护与考古研究所杨清平研究馆员的著作《左江花山岩画与相关考古遗存的关联性研究》及其主持编写的《广西左江花山考古（2013—2016）》两项成果获成果著作类和报告类三等奖。

2024年4月，柳州市联合中国社会科学院考古研究所、广西文物保护与考古研究所对凤岩遗址进行了为期5个多月的考古发掘，清理出一座距今四万至三万年的墓葬，为认识柳州乃至整个华南地区早期现代人起源与扩散、人类体质特征等提供了重要资料。