朽木元纲（1549年-1632年10月12日），日本战国时代后期至江户时代初期的武将，大名，寄合旗本。他的父亲是朽木晴纲，母亲是飞鸟井雅纲的女儿。他的儿子有宣纲、友纲、纲，女儿是堀直政的妻子。朽木元纲在两岁时继承父亲的位子，成为家族的领导者。

朽木元纲在1550年继承了父亲的位子。1553年，他藏匿了被三好长庆追放的室町将军足利义辉。1566年，浅井长政进攻高岛郡，元纲送出人质请和。1568年12月，他与浅井久政、长政父子交换起请文，但不久后破弃。

1570年，朽木元纲在朝仓义景的攻击时，被松永久秀说服协助织田信长往京都方向撤退。朝仓一族败后出仕织田信康家，成为信长部下矶野员昌的部将、后仕于津田信澄。1579年代官职务遭到罢免，自此不再受到信长优厚待遇。

信长死后出仕秀吉，担任伊势安浓郡及近江高岛郡内的藏入地代官一职。之后也有出阵小田原合战，认功受封朽木谷2万石。

1600年的关原合战中，朽木元纲最初加入石田三成的军队，但在小早川秀秋倒戈后，他与坂康治、小川忠和赤座直保一起背叛了三成。战后，德川家康因为这一功绩让脇坂康治管理他的领地。

1616年，朽木元纲剃发出家，法号牧斋。他在朽木谷去世，享年84岁。元纲死后领地被宣纲、友刚、植纲三子分割，因此而失去大名资格，被降为旗本（6,300余石）。之后三子稙纲受到第三代将军德川家光的信赖而成为大名，子孙重新得势。