藤原氏宗的职业生涯始于832年，当时他担任了上总大掾一职。随后，他在政府机构中担任了一系列职务，包括中务大丞、六位
藏族以及式部大丞。到了838年，他晋升为从五位下，并开始担任式部少辅。在
仁明天皇时期，他还担任过左
少将、左右卫门权佐等武官职位，并兼任右少辨、右中辨。
842年，藤原氏宗被任命为陆奥守，并在此基础上晋升为从五位上。同年，他开始负责接待来自
渤海国的使节。848年，他成为春宫亮，辅助皇太子道康亲王。随着道康亲王后来登基为
文德天皇，藤原氏宗被提升为藏人头，并兼任右
中将、右大辨。852年，他被授予参议的职位，正式成为公卿之一。之后，他又先后担任了检非违使别当、左卫门督、左右大辨等重要职务。
858年，
清和天皇继位后，藤原氏宗的官阶再次得到提升，达到了正四位下。次年，他晋升为从三位。864年，他成为了权大纳言。867年，他的官位上升至正三位，并担任大纳言。到了870年，藤原氏宗最终被任命为右大臣。然而，在872年，他在任职期间去世，享年62岁。朝廷为了表彰他的功绩，追赠其为正二位。