马萨里克大学是捷克最古老、最大的大学之一。直到第一次世界大战结束，奥匈帝国瓦解之后，布尔诺才建立了其第一所大学。1919年1月28日，法律公布拥有四所学院-法学院、医学院、理科学院及文科学院的捷克马萨里克大学在布尔诺建立，以具有卓越贡献的捷克斯洛伐克首位总统Tomáš Garrigue Masaryk命名。

马萨里克大学以其高度的知识能量与抱负，很快在许多领域赢得了很高的荣誉。马萨里克大学法学院是该大学的骄傲。“布尔诺的法学院”以标准化法律理论为基础，取得了国际荣誉。马萨里克大学的其它学院也同样充满活力，取得了很大的成功。

1964年教育学院合并入马萨里克大学，1989年11月之后再度繁盛。1990年，经济与行政管理学院成立，随后于1994年建立信息学院，1998年社会研究学院社，并于2001年建立体育研究学院。作为国际合格，大学的研究活动也大大增加，不仅有双边合作(与单个国外大学)还包括Compostela Group of Universities大学集团内的合作。

今天，马萨里克大学是捷克公认的最重要的教育和研究机构，是一所遵循民主传统的、值得尊敬的中欧大学。马萨里克大学也是布尔诺及周边地区主要的社会和文化支柱。

马萨里克大学设有9个学院，共有200多个系、专科学院及讲习所，涵盖了广泛的学科和研究领域。

法学院 – 法律专业、法律与法学、理论法律科学

医学院 – 护理、健康科学、普通内科、口腔病学、牙科专业

理科学院- 数学、应用数学、地质学、地理学、地理与绘图学、应用地理、生物化学、化学、应用生物化学、生物学、人类学、人类生物学、物理、应用物理、中学师资培训

文科学院- 哲学、人文科学、历史科学、信息与图书馆学、语言学、教育学、专业教育学、一般理论及文科与文化史论、中学师资培训、小学师资培训

教育学院 – 教育学、小学师资培训、特殊教育学、专业化教育学、中学师资培训、教学助理培训、健康科学、美术理论与历史、乐理与历史

经济学院-经济学理论、经济政策与行政管理、经济与管理、系统工程和信息学、经济学定量分析法

信息学院– 信息学、应用信息学、中学师资培训

社会研究学院-人文科学、政治学、国际区域研究、社会学、社会政策与社会工作、政治学、人文环境、媒体与传播学

体育研究学院 – 体育与运动、亲属人类学