昆明鱼（Myllokunmingia），是一种原始及可能属于无颔总纲的鱼类，生存于寒武纪的中国云南澄江县帽天山。

昆明鱼的外观像现今的盲鳗科，长约2.8厘米、高6毫米，表皮上没有鳞片和膜质骨板。昆明鱼身体呈纺锤形，具明显的头部和躯干。背鳍前位，腹侧鳍褶从躯干下方长出，很可能是成对的，无鳍条；头部具5或6个鳃囊，每个鳃囊具有前、后两个半鳃，鳃囊可能与围鳃腔相通。躯干约有25个肌节，皆为双“V”形结构，腹部“V”形尖端指向后，背部“V”形尖端指向前；脊索、咽和消化管可能贯穿身体到尾部；可能具有围心腔。

昆明鱼只有一块正模，其尾尖还保存在围岩里，未暴露。由于软体化石保存条件的限制，昆明鱼某些特征（如肌节形态，腹位鳍褶是否成对）的解释仍存争议或不确定的地方，这直接影响到昆明鱼系统学位置的确定。1999年，来自中国西北大学的古生物学家舒德干等在世界著名的科学杂志《自然》上公布了他们对于昆明鱼的发现。昆明鱼是世界已知最早的鱼类之一，也是最古老的脊椎动物的代表。

迄今已知的地球生命出现早期的最高等动物化石Myllokunmingia

1999年11月4日，国际学术界公认的权威科学刊物《自然》，以最高规格刊载了一篇划时代的地球生命科学论文--《华南早寒武纪脊椎动物》，介绍了两块发现于中国云南5.3亿年前早寒武纪筇竹寺地层中的鱼化石——"海口鱼"与"昆明鱼"。这两块鱼化石把人类所知的脊椎动物产生的时间向前推进了约4000万年，是地球早期动物进化研究上的又一重大突破。

1997年8月，云南地质科学研究所的地质学家来到昆明海口地区进行野外考察，发现了与澄江市动物化石群中"云南虫属"脊索动物门大不一样的东西，竟然是一条鱼，而鱼是脊椎动物，比脊索动物更高级。这一发现又经过与西北大学早期生命研究所共同研究，把它取名为"海口鱼"。1998年12月，专家们又在昆明海口地区发现了第二块脊椎动物化石，被命名为"昆明鱼"。

1999年4月，在"早期脊椎动物起源及演化重大事件"国际会议上，中原地区科学家向会议展示这两条鱼化石的照片时，引起全场强烈轰动。专家们一致认为，这是迄今已知的地球生命出现早期的最高等动物化石，这一发现代表了关于寒武纪生命大爆发研究中最重大的关键性突破。英国和德国的著名古生物学权威都一致认为：这是了不起的发现，是20世纪国际古生物学界最重要的科学成果之一。

比较原始的无颌鱼类，表皮无骨骼和鳞片，身体呈纺锤型，可分为头部和躯干部两部分。背鳍前位，腹侧鳍从躯干下方长出，很可能为偶鳍，无鳍条；头部具5个至6个鳃囊，每个鳃囊中具有半鳃结构，鳃囊可能与围鳃腔相通。躯干约有25个肌节，皆为双“V”形结构，腹部“V”字尖端指向后，背部“V”字尖端指向前；内部解剖构造包括咽腔、肠道、脊索以及可能的围心腔。产自云南省昆明市海口镇下寒武统竹寺组玉案山段(始莱德利基虫带)。昆明鱼的发现，不仅将包括人类在内的整个脊椎动物演化史向前推进了5000万年，而且改写并完善了脊椎动物早期演化理论。

昆明鱼是已知最古老的脊椎动物，在5亿3千万年前寒武纪的地层被发现。它似乎是有由软骨构造的头颅骨及骨骼。它的骨骼并未有出现生物矿化的迹象。

完模标本是在中国云南昆明筇竹寺组发现。昆明鱼有明显的头部及躯体，并有像帆的背鳍及腹鳍。头上有5或6个有半鳃的鳃囊。身体上有25节，有脊索、食道及消化道至末端。口部不能明显的见到。可能有围心腔。只有一个昆明鱼的标本尾端埋在沉积岩中。

另一类在同一地层的相似生物有海口鱼。目前昆明鱼只有一个物种，就是丰娇昆明鱼。