木鱼花味道十分鲜美，是一味极好的调味品，可以给食物增添风味。
日本菜的多个环节通常都有木鱼花的存在，木鱼花汤也是是烹制日餐不可缺少的配料。
木鱼花常见于日本料理，通常用来煮汤或者直接撒在菜上面，也会放在面包和各式糕点上点缀，或者用作内陷。常见于以下日料中：木鱼花汤、
章鱼烧、鱼丸羹、蜜汁木鱼花
饭团、木鱼花豆腐、木鱼花炒饭、木鱼花泡饭等。
木鱼花汤：将昆布（一种海藻）放入冷水中浸泡1-2小时，接着用60-70度热水煮20分钟，捞出昆布，水不要倒掉，煮沸后关火放入木鱼花，即可得到一种清淡而香浓的汤汁，叫做“
清汤”。这种汤汁是
日本菜中最基本的
高汤之一。
木鱼花泡饭：蒸米饭时加入一小勺
米酒添香，蒸熟后把蘸了
酱油搅拌均匀的木鱼花放在米饭上，再加入一点
芥末和其他佐料，最后把泡好的煎茶倒进碗里，就是一碗木鱼花泡饭。
章鱼烧：将
低筋面粉、水、
鸡蛋、等混合成面糊并冷藏，冷藏30分钟后加入章鱼块、虾肉或其他肉类，放入特制的模具中煎烤成焦褐色球状，淋上酱汁，根据喜好加入
沙拉酱或其他酱料，撒上木鱼花和海苔碎，就是一种受欢迎的小吃。
木鱼花需要真空保存或者
氮气保存，减少木鱼花和空气接触，以免出现受潮或者氧化。为尽量保持原有香味和延长保质时间，厂家通常会把木鱼花包装到高成本全密封
塑料袋中并充入氮气。开封后最好尽快用完，没有用完的木鱼花需放入冷藏保存。
木鱼花具有很高的营养价值。它是由
深海鱼制作而成的，深海鱼是鱼类中最具营养价值的，富含DHA和EPA，这两种是人体必需的不
饱和脂肪酸。DHA有“
DHA藻油”之称，能促进神经系统发育、预防近视和改善视力。EPA则有“血管
清道夫”之称，可以辅助预防贫血、辅助提高身体抵抗力等功效与作用。