郑州市第六人民医院前身为郑州市传染病医院，1953年9月1日在郑州市祭城郑县筹建“郑州市隔离医院”。1954年改名为“郑州市传染病医院”。1987年搬迁到郑州市南郊，更名为“郑州市第六人民医院。”46年来医院几经搬迁，经历了一个规模由小到大、专科由少到多，能力由弱到强，功能不断完善的发展过程。近两年，医院先后荣获市级“文明单位”、“卫生单位”、“花园式单位”和“十佳医院”称号。

1953年成立郑州市隔离医院；

1954年更名为郑州市传染病医院；

1985年更名为郑州市第六人民医院；

2001年与郑州市结核病防治所合并；

2006年被原河南省卫生厅批准为“河南省传染病医院”

2021年8月28日，郑州市中高风险区清零，封闭、封控区域全部解除。

2023年12月，郑州市第六人民医院与郑州市人民政府等正式签订《合作共建郑州大学附属传染病医院协议》。

学科建设科学规范，设置临床科室48个，医技科室17个。近年来，医院提出“精专科、强综合，坚持防治一体”的办院方针，形成了以艾滋病、结核病、肝病和感染性疾病四大学科为基础，内科、外科、妇产科、小儿科、重症医学科等为一体的传染病综合救治体系，收治全部法定传染病，HIV母婴阻断率达到100%，实现了河南省艾滋病心脏手术零的突破，艾滋病患者来自全国各地，传染病综合救治立足河南，面向中部六省、辐射全国。

医院目前拥有省级重点培育学科、省级中医重点专科、省级医学重点实验室、省级科研平台等14个。

医院配备有1.5T磁共振系统、64排螺旋CT、移动方舱CT、数字减影血管造影机、人工肝分子吸附循环系统、全自动快速微生物质谱鉴定仪、全自动病原体快速检测系统、流式细胞仪、体外循环机、分枝杆菌快培检测系统、体外膜肺氧合（ECMO）等先进诊疗设备  。

医院在职职工1456人，其中博、硕士研究生209人、高级职称128人、中级职称179人。

医院地处省会郑州市南郊，占地57000平方米，建筑面积2万多平方米，主要设有传染科、内科、外科、妇产科、五官科、口腔科、眼科、中医理疗科等，可开设病床280张职工315人，其中高级职称22人，中级职称84人，主要收治各型病毒性肝炎、肝硬化、流行性出血热、各种脑炎、麻疹伤寒等传染病。肝病是六院重点专科、在肝病治疗方面积累了丰富的临床经验。1995年度被郑州卫生局确定为“郑州市肝病防治中心”。中心设有肝病临床研究室，肝病实验室及肝病药物研究室，对各类肝病、特别是对重型肝炎的诊断、治疗、抢救已达到国内先进水平。医院对病毒性肝炎的病原学检测手段在省内属于领先地位，现已开展甲、乙、丙、丁、戊、庚肝炎病毒的免疫学检测。医院还购置了大型医疗设备如欧林巴斯纤维胃镜、日本Aloka33D-620型超声诊断议、美国惠普全导联心电图仪、18导全自动脑电地形图仪、电脑肝病治疗仪、血液净化仪、腹水超滤浓缩回输机等先进医院设备，医院博众家之长，发挥了自身优势，经各痊专家的共同努力，筛选研制出纯中药治肝系列药物：肝炎病毒转阴三联制剂、软肝宝胶囊、胆肝康胶囊、疏郁安神丸、消疸口服液等，在临床收到了良好效果。院大力发展“科技兴院”战略。近年来有100多项新技术、新疗法得到推广应用，获得9项省市科研成果，主编、参编30余部专著，在国家省市医学杂志上发表论文200余篇，医院与北京大学医学部、解放军302医院建立了长期协作关系，成为北医大肝病研究所临床基地。

郑州市第六人民医院是一所以传染病为主要特色的大专科小综合性医院。医院开设病床280张。设有传染科（包括：肝病、结核病、性病、艾滋病和其它各类传染病），内小儿科、外科、妇产科、口腔科、眼科、耳鼻喉科等12个临床科室。放射科、CT室、介入治疗室、功检科、检验科等7个医技科室、主要诊疗设备有美国GE1600C全身CT机、OEC---7700C型臂x光机、500MA双管双床X光机、18导全自动脑电形图仪、日本Aloka超声诊断仪、欧林巴斯胃镜、欧林巴斯支气管镜等医疗设备及美国AG-900免疫荧光定量PCR、自动生化分析仪等检验设备、病理设备及各种抢救监护设备。

传染病诊治和结核病防治是医院的主要诊疗项目。

原党委书记：马淑焕

河南省感染性疾病分子检测医学重点实验室为河南省医学重点实验室，郑州市肝病重点实验室为郑州市重点实验室。

2017年12月16日，“中部地区肝炎学术交流会暨郑州市医院协会传染病分会2017年年会”在医院多功能厅隆重召开。医院党委书记马淑焕、副院长刘建民，以及从事肝病领域研究与临床的专家、学者、医生150余人参加此次会议。会议由副院长刘建民主持。

医院先后荣获“全国结核病防治先进单位”、“全国巾帼文明岗”、“全国综合医院妇幼保健机构中医药工作示范单位”、“河南省传染病防治工作先进集体”、“河南省结核病防治工作先进集体”、“河南省防治非典型肺炎工作先进基层党组织”、“河南省医院管理年先进单位”、“河南省构建和谐医患关系工作先进单位”、“河南省医改创新示范医院”、“河南省群众满意的医疗卫生机构”、“全省卫生系统安全生产先进单位”、“郑州市卫生系统先进集体”、“郑州市疾病预防控制工作先进集体”、“郑州市廉医、诚信、为民、和谐医院”等光荣称号。

2020年10月18日，郑州市第六人民医院重症医学科被评为河南省抗击新冠肺炎疫情先进集体。

2021年7月31日，根据当前疫情防控形势，为保障广大市民健康安全，郑州第六人民医院停诊。

依据《中华人民共和国社会保险法》《郑州市医疗保障定点医疗机构服务协议》和《郑州市基本医疗保险定点医疗机构医保医师管理暂行办法》，当地医保部门处理结果如下：1、取消该院骨科主任陈某某、骨结核科主任钱某某等责任人医保服务支付资格；2、自2021年4月28日零时起，中止该院骨科和骨结核科的医保基金结算；3、追回损失的医保基金，并处以5倍罚款；4、相关问题线索移交郑州市纪委监委派驻市卫健委纪检监察组、市公安局和市市场监管局等。目前，郑州市纪委监委派驻市卫健委纪检监察组已对该院骨科主任陈某某、医学装备科科长雷某某予以立案审查（调查）；郑州市公安局二七分局已对该线索立案侦办；损失的医保基金1741491.50元已全部退回，5倍罚款8707457.50元已全部执行完毕。