2000年5月9日,郭瑞龙接任
苏永舜成为深陷降级区的
成都天诚足球俱乐部主教练,并帮助球队在该赛季成功留在甲B。2001赛季,他和队中球员矛盾激化,9月16日,他在0比2不敌垫底球队
天津立飞足球俱乐部后被解雇。当年12月,他成为深圳平安的领队和第一助理教练。
2005年2月,在
朱广沪上调国家队后,郭瑞龙代理球队主教练率
深圳市足球俱乐部参加A3联赛。5月17日,
迟尚斌因球队内部矛盾激化而下课后,担任深圳队教练组组长,期间率队参加
亚足联冠军联赛,在深陷财政危机的情况下淘汰
韩国的
水原三星蓝翼足球俱乐部和
沙特阿拉伯的阿赫利后,打进四强。但在10月14日,他被俱乐部解雇。
2007年12月,郭瑞龙重新出山,来到安徽九方队担任主教练。2008年4月15日以个人身体健康欠佳辞职,只在安徽队待了4个月。2008年6月,在乙级球队
温州葆隆足球俱乐部担任主教练。