万佛寺，原名万佛阁，始建于赵祯年间，鼎盛与宋明两期，梵宇庄严，法务兴隆，成为延陵名刹。15年来，万佛禅寺先后建起了文殊殿、普贤殿、观音殿、藏经楼、大雄宝殿、方丈楼等，建筑面积22000余平方米，总投资7000余万元。

熟料万法无常，世事风云骤变，日本侵华期间，敌寇扫荡，千年古刹遭此大劫，毁于一旦，片瓦无存，几成废墟，数十年来，未缘修复。随学上人于一九九三年末来到此地，乃生菩提心，发宏誓愿，立志重修、修复古刹。1993年6月批准为佛教活动场所，2001年更名为“万佛禅寺”。寺院的建筑在依据佛教历史渊源、结合佛教教义教规的基础上发挥了自己的特色，气势雄伟，佛像庄严。现常住寺院的四众弟子有100余人，出家众约40人众，护法大居士久住珈蓝护寺的40余人，每年的香（游）客约20余万人次。

2008年11月29日，江苏省省级重点文物保护单位镇湖万佛寺经过一年多的修缮，以全新的面貌与游客见面。这不仅将对寺内的“宝物”——万佛石塔起到更好的保护作用，还为苏州镇湖生态旅游增添了新的宗教文化元素。

据苏州市高 新区民族宗教局负责人介绍，现　在落成的是新寺规划的一期工程，前期规划经过了各方面的多次论证，以尽可能地对石塔起到更好的保护作用。首先，是大殿保留了宋代建筑风格，体现了与石塔的一致；其次，由于石塔高度为11.4米，寺内的大殿以及周边的建筑都低于这一高度；另外，以石塔为中心，划出了绝对的核心保护区域，有专人进行管理。

自1957年落成以来，万佛寺都有一个传统，每逢农历正月十五元宵节同四月初八浴佛节，会举行参佛转运既仪式，由法师主礼诵经，祈求香港特别行政区繁荣，世界和平. 每次为数约五百人拜佛，各人手持清白一炷，跟法师围绕一圈，法师仲会用白米系长桌上万砌出丁，财，贵，寿，慧五字，俾善信参拜后，拿小量番屋企煮黎食，据说有转运解难既作用. 除左呢两日外，最多人黎就系年初三，因为好多人会去完车公庙拜神，顺道再黎万佛寺拜一拜.