石湖港有3公里长的
深水港道延伸入
蚶江港，
海床为平底
花岗石结构，常年不淤，水深18米，退潮时最浅14米，
涨潮时最深36米。港道从石湖外屿至北线，滩宽2000米，长7200米，可供万吨级船舶停靠，是良好的深水锚地。
1987年石湖港侧小坠门航道进行整治，万吨级船舶顺利进入石湖锚地。1988年8月，载重2.58万吨的货轮“云岭”号，装载2万吨
澳大利亚原糖，乘涨潮时通过小坠门航段进入石湖港锚地停泊。1993年兴建万吨级多用途泊位码头，泊位长200米，年吞吐能力40万吨。总投资16.7亿元。该码头于1996年4月由交通部三航局六公司承建。至1997年9月全部完成水上工程。
2021年8月17日晚，随着船舶“盛达安顺”的顺利靠泊，内贸集装箱航运公司信风（宁波）海运物流有限公司“
太仓市—
海口市”航线（原集韵物流航线）在石湖港正式上线。该航线的开通打通了
泉州市往来长江流域货物的海运新通道，也标志着双方的战略合作再上新高度。