石松亚门（Lycophytina）是蕨类植物门门下的1个亚门，其历史可追溯到古生代。该亚门有2目3科9属为土生小型至大型蕨类植物，分布于世界热带和亚热带，少数达北半球温带，中国有5属。

该亚门植物在石炭纪时最为繁盛，有高大乔木及草本，后绝大多数相继绝灭，现存的只有石松目和卷柏目，均为草本。该亚门模式物种是石松（Lycopodium japonicum Thunb. ex Murray）。

孢子体有真根，茎多为二叉分枝，通常具原生中柱，具地上气生茎。

小型叶螺旋状排列，有时对生或互生，仅1条叶脉。孢子囊单生孢子叶腋或近基部，孢子叶通常集生于枝端形成孢子叶球。孢子同型或异型。同型（如石松）和异型（如卷柏）之分。

配子体极度退化，柱状，不规则块状等。无叶绿素，与真菌共生；有的部分组织含叶绿素；有的种类在孢子壁内发育。

精子纺锤形或长卵形，具两条鞭毛。

广泛分布于世界各地，尤以热带和亚热带最为丰富。

石松属常见种有石松，其孢子在工业上称为石松科，含40%的油脂，为铸造工业的优良脱膜剂，亦可用作闪光剂和丸药用包衣。

中国民间用某些种的全草作药用，能祛类风湿性关节炎，舒筋活络。

近年有些人主张将石松科分为石杉科（Huperziaceae）和石松科（Lycopodiaceae）两科，石杉科茎短而直立，一至多回等位二叉分歧，孢子囊不聚成明显的穗状，有石杉属（Huperzia）和马尾杉属（Phlegmariurus）2属；石松科茎长而匍匐，不等位二叉分歧，孢子囊聚生枝顶成穗状，有5属，即石松属（Lycopodium）、扁枝石松属（Diphasiastrum）、垂穗石松属（Palhinhaea）、小石松属（Lycopodiella）、藤石松属（Lycopodiastrum）；又将不分枝的另立为舌叶蕨科（Phylloglossaceae）。