黑寺在北京海淀区东升乡马甸村西。原为前后两寺，中以一街相隔。两寺与附近的黄寺同为喇嘛庙，因覆以黑瓦，故俗称黑寺。前黑寺原名慈度寺，建于清朝初年。坐北朝南，有殿5重，民国年间烧毁。后黑寺原名察罕喇嘛庙，为东蒙察罕呼图克图活佛于清顺治二年(1645)募化创建。寺坐北朝南，原有殿3重，寺门额曰“清代古刹”。寺内依次为天王殿、正殿、后殿、活佛仓和后院。

前黑寺原名慈度寺，位于德胜门外马甸，如同黄寺按方向分为东、西寺一样，黑寺则按方位亦分为前、后寺。两寺因覆以黑瓦，故俗称黑寺。历史上黑寺以打鬼(跳布扎)、历科武会试、雕塑精品这“三绝”闻名遐迩，遗憾的是，黑寺毁于民国年间，“三绝”也自然荡然无存。

据《日下旧闻考》记载：前黑寺本名慈度寺，黑寺是其俗称，以其覆以青瓦故有是称。建于清朝初年，建殿五层，山门、天王殿恭悬圣康熙帝皇帝御赐慈度寺额。第四层大殿前恭悬圣祖额曰：法云广润。寺内铁钟、铁皆明万历年造，当是它处移至者。这座寺庙毁于民国十四(1925年)年，由于未能重建，遂逐渐荒废，竟连遗址亦未留下。

后黑寺为蒙古察罕呼图克图活佛于清顺治二年(1645年)募化创建。寺坐北朝南，原有殿三重，依次为天王殿、大雄宝殿、后殿，另有活佛院和后院。大雄宝殿正中供奉三世佛、左供观音大士、右供关羽像，故老百姓又称关公殿，东西配殿各5间，建筑甚坚。后殿供无量寿佛，后院共有房20余间，另有菜园数亩。廊下古钟遍刻梵文，铭曰：“静以居，应以虚警大千归真”云云。后黑寺亦毁于民国年间，当时仅留存下来古及乐器数件，后亦遗失。今仅存有东西两座配殿等建筑。

黑寺寺寺内还曾有明正德十年最胜寺大钟一口，证明了古刹之说。黑寺的地址在今天海淀区东升乡马甸村西，顺治帝钦定此庙为察罕喇嘛庙，并从昌平区、顺义区、延庆区等县拨给土地75顷又266亩和300饷粮以保证寺内僧人生活。该寺坐北朝南，原有殿宇三重，依次为天王殿、正殿、后殿、活佛仓和后院。

正殿供奉的是三世佛，并供有关羽像，故又称为关公殿，这是因为在藏传佛教界，特别是在蒙古族僧俗信众中，关公被认为是红脸神-------大红司命主的化身，故在蒙古族藏传佛教寺庙多供有关公殿。后殿供奉的是大清康熙帝御赐的无量寿佛，这也是黑寺的镇寺之宝。活佛仓在后殿的西北，为东西两座四合院建筑，有房屋20余间。后院有坐北朝南的大殿3间及耳房数间。此外，寺内还有明正德十年（1515年）最胜寺的大钟一口，此钟现保存在雍和宫。每年的正月二十三日，黑寺都举行驱鬼法会，也叫“跳查玛”。黑寺毁于民国年间军阀混战，被军阀李景林部队抢掠后放火焚烧，据2006年底才圆寂的老僧人讲，当年黑寺的大火整整燃烧了半年。

北京黑寺与内蒙古自治区的渊源缘于察罕活佛。察罕活佛，又称为“白活佛、查干活佛”。该活佛第一世至第四世转世于西藏自治区，第五世至第九世转世于内蒙古赤峰市，是阿鲁科尔沁旗罕庙的寺主活佛，是大清朝钦定的驻京八大呼图克图之一，位列章嘉活佛之后，这也是唯一的驻京任职的蒙古族大喇嘛，曾累世被顺治帝、康熙帝、雍正帝、爱新觉罗·弘历、爱新觉罗·旻宁、爱新觉罗·载淳、光绪帝、爱新觉罗·溥仪等任命为多伦县掌印扎萨克喇嘛和总理京城及内蒙古各盟旗喇嘛事务的京城喇嘛印务处副掌印扎萨克喇嘛等职务。特别是道光皇帝曾把自己穿的龙袍和黄袍赏赐给察罕活佛，这在大清历史和藏传佛教历史上都是绝无仅有的。此外，历世察罕活佛出行可乘坐皇帝赏赐的黄轿，这种待遇也是不同寻常的。由于察罕活佛在藏传佛教界和大清王朝功德卓著、地位显尊，黑寺在京城也就成了与黄寺齐名的藏传佛教名刹。现在住世的察罕活佛为第九世察罕达尔汗呼图克图那日松活佛（曾用名那木吉勒），于1944年农历10月18日生于内蒙古自治区赤峰市阿鲁科尔沁旗罕庙苏木牧民贡布家。现为中国佛教协会常务理事、内蒙古佛协副会长。

第九世察罕那日松活佛的寻访认定是由第五世杨松吉木彦活佛（又称云僧活佛或永生活佛，与察罕活佛、西活佛同为罕庙的三大活佛，其本庙为阿鲁科尔沁旗的根培庙）亲自主持寻访，于两岁时由十世班禅大师和章嘉活佛正式认定，并赐法名罗布桑格力格利戈如达日斋。为了恢复和重建北京黑寺，察罕那日松活佛多次向有关部门打报告，提建议。他说：恢复和重建黑寺是我一生中最重要的夙愿之一。

1860年，英法联军入侵北京，在劫掠圆明园的前一夜，就是在黑寺驻扎的。当时的马甸一带是一片草滩。10月5日，联军先头部队向城北安定门、德胜门附近逼进。6日，近千人抄至德胜门土城外。此时清军已成惊弓之鸟，史载，“马队则望影而逃，步队亦闻风而窜，以致逆夷如入无人之境”。联军由黄寺、黑寺直趋西北，进攻圆明园。

黑寺、黄寺和雍和宫同为当年北京最重要的喇嘛寺。每年春节期间喇嘛庙的打鬼是一项在民间有重要影响的活动，雍和宫打鬼在正月十五，黑寺打鬼在正月二十三。山东省杨蔼堂先生的未刊稿，回忆1922年到黑寺参观喇嘛打鬼的情况。文中说：寺在德胜门外西北约二里，分前后寺，寺之主持即蒙古活佛与喇嘛，清代时势力极大，亦即怀柔政策之一。每逢正月二十三，即大演打鬼会。或云所打之鬼即杨延嗣。因胡人最怕杨七郎，亦即畏七郎之鬼。又云打者乃冤鬼，因怕冤鬼扰乱人间也。二说未知孰是姑并存之。也不外乎一种迷信。抵寺时，见山门外摆一辇。旋见群僧蜂拥而出，扮鬼者衣白衣面戴假面具，手握白粉，随跑随撒。打鬼者皆彩衣，扮演牛头马面，或青脸红发，或巨齿獠牙，皆手执皮鞭见人就打。名为打鬼，实则打人。群鬼之前为仪仗，为锣鼓。群鬼之后为音乐，为活佛。最后为黄辇，辇中之木偶，或即释迦牟尼也。由此可见，到1922年，黑寺举行的宗教活动还是热闹而且正规的。

黑寺的败落应与火灾有关。光绪十六年(1890年)农历九月初四，为了举行武试(选拔军事人才)，朝廷兵部在黑寺前搭建帐篷，帐篷外搭席棚，帐篷里设考试棚、伙食棚，结果厨房棚半夜着火了。当时的消防档案中说：霎时烈焰腾空，火星飞爆，虽经该部员役人等赶为扑救，无如席棚易于引火，而火势愈烧愈烈。这事闹得挺大，以致武试因而延期。不过从材料上看，这次失火还没有对黑寺内部造成太大的损失，所以杨蔼堂先生1922年还在那里观看了热热闹闹的打鬼仪式。此后有“民国年间大殿焚毁，寺遂败落”的记载，但现在还没查到具体的火灾时间和记录。到1948年，黑寺已经只剩了两间荒芜的大殿，有人利用这个简陋的地方办起了私立的燕山中学，到建国初，这所学校只有几十个学生。再后来，这里就成了马甸回民小学的校址，后来改称北京市海淀区民族小学。

每年正月二十三日寺中举行打鬼活动。打鬼之日，黑寺殿上广陈供奉，燃灯数百盏。殿的四角，各竖一面大旗，上绘四大天王像。仪式开始，由喇嘛“戮由巴”鸣金，招集僧众上殿。众喇嘛皆列座。首先由一喇嘛名“茶勃勒气”往众喇嘛手上洒净水少许，谓之“打净”，然后以醍醐拌面，做成施与众鬼吃的“胡朗八令”。接着是由“班第”扮二鬼，跳跃舞蹈。象征邪祟初露，夜叉神奉大白伞盖佛巡游，见之欲以擒拿，但仅向其一呼，二鬼即逃匿无踪了。此时柄鼓、大钹，以及一丈多长的大铜号——“钢冻”起奏音乐，声震殿宇。一些小喇嘛们为了扩大场地，便扬起白土子，说谁被沾上便一年晦气，所以观众们自动后撤。随着音乐节奏，“哈素尔”12人，戴着面具，装扮天神天将，双双舞蹈，出殿庭而下。又有“哈愣”10人，扮成十地菩萨，穿着五彩斑斓的锦衣，大舞特舞，象征要以佛法收伏邪魔。随后，温则忒宣开经偈，众喇嘛高声唪诵经咒。这时“喇木占巴”扔了“八令”面，表示向众鬼施食。再由二喇嘛扮成的牛头护法和鹿头护法，边舞边持刀砍地，作杀鬼姿势，表示将邪魔正法。最后，一喇嘛盔甲戎装，持方天画戟，从殿上吐着火焰跳跃而出，表示打鬼告捷。这时，观众们都不约而同地向其顶礼膜拜，还有的藏蒙香客、游人把事先准备好的哈达献上去。

跳罢“布扎”，就要送鬼——把一个象征鬼的面人送到山门外火化，送鬼的行列浩浩荡荡。送鬼之后，游人们纷纷扛着大糖葫芦、摇着五彩风车，小孩们或脖子上挂着大串山里红，或提着小空竹等玩具散去。此时“紫陌飞尘，轻车驷马，鱼贯入城，而日已近山矣。一年一度的黑寺打鬼就宣告结束了。

黑寺的神像雕塑堪称京华精品，可惜的是文献记载较少，且留下的图片甚少。