崔文仲初任
冀州从事,后转为
徐州市刺史薛安都的平北
主簿。泰始二年(466年),薛安都在内的
淮北市诸州皆拒绝承认
刘彧的帝位,而支持
刘子勋政权,但明帝故意派
沈攸之及
张永以重兵迎降以作示威,逼令薛安都惧祸而转投
北魏,最终北魏军成功接收淮北诸镇并击败宋军。崔文仲面对此情形仍排除万难逃回南方。
元徽二年(474年),江州刺史桂阳王
刘休范领兵进攻
建康,崔文仲随
萧道成到新亭御敌,并归事道成,事平后授游击将军。
昇明元年(477年),荆州刺史沈攸之起兵反对萧道成专权,
司徒袁粲等人在建康响应,萧道成儿子
萧嶷其时驻镇东府,崔文仲助其守卫,终道成亦将起事众人消灭。升明三年(479年),后被萧道成排挤至任
宣城市太守的
萧鸾宠臣
杨运长弃官还家,道成就派文仲杀害运长。
建元元年(479年),道成篡宋建齐,崔文仲外任
徐州市刺史,封建阳县子。
建元二年(480年),时值
北魏军进攻
垣崇祖守戍的寿春,崔文仲领兵击破进攻
钟离姓的北魏别军,又派军主
崔光领兵北渡
淮河攻陷茬眉戍,杀戍主龙得侯、魏阳平
知府郭杜羝、馆陶令张德、濮阳令王明等人,捷报传到
建康时
萧道成认为这是抵销其时北魏攻杀马头太守刘顺之败。随后崔文仲再分别派军主
陈靖及崔延叔进攻竹邑戍及
淮阳区郡,杀了竹邑戍主白仲都及淮阳
太守梁恶。而文仲在徐州的作风令当地人都很害怕。后调回朝任黄门郎,领
越骑校尉,并改封为
随县子。
永明元年(483年)改任太子左率。后又至
征虏将军、冠军
司马、
阜阳市太守。永明四年(486年)去世,赠
后将军,
徐州市刺史。谥襄子。