明朝大臣、抗倭名将。字子纯，号秋崖，苏州府长洲县（今苏州市）人。嘉靖十五年(1536年)，在四川省兵备副使任上，配合副总兵何卿平息少数民族叛乱。嘉靖二十五年(1546年)，升为右副都御史。次年，任提督闽浙海防军务。

正德十六年(1521年)进士，历官脩县知州、开州知州、南京刑部员外郎、四川兵备前使、广东省左布政使。朱纨有《余录》十二卷传世。

朱纨被迫害致死后，明廷也自此罢巡视大臣不设，地方政府不敢言谈海禁，倭寇更加猖，荼毒东南沿海。

弘治七年（1494年）农历九月初一日（9月29日），朱纨生于狱中，从小生活贫苦。

正德十六年（1521）进士。历官景州知州、开州知州。嘉靖初年迁移为南京刑部员外郎。历四川省兵备副使，屡迁至广东左布政使。

嘉靖二十五年（1546年）擢右副都御史，巡抚南赣。

嘉靖二十六年（1547年）改提督浙、闽海防军务，巡抚浙江省，防御倭寇。明朝初年朱元璋曾经定制，片板不许入海。当时，倭寇大肆侵扰东南沿海。浙闽海防废坏不堪，战船、哨船十存一二。海盗商人、浙闽豪门势家多与倭寇勾结，假济渡为名，造双桅大船，运载违禁货物。将吏不敢诘。

朱纨为官清正，强力敢认，是个难得的贤臣。初到闽浙，朱纨很快发现，所谓的“倭寇”其实并非明朝初年那样的日本海盗。除了极少数被中国人雇来武装押运的日本浪人外，绝大多数都是闽浙沿海靠海外贸易求生的中国人。由于闽浙沿海的人地矛盾十分突出，而宋元以来数百年的海上贸易已经成为东南沿海居民最重要的求生之路。即使在严禁海外贸易的明朝，这种生活方式也没有改变。只要海禁稍有松懈，走私贸易就会蓬勃发展，以至于闽浙沿海几乎家家户户都涉足走私贸易，从而直接或间接的与“倭寇”有关。于是乎，朱纨上任之后，便在沿海厉行保甲连坐制度，并大力整顿海防。闽浙沿海的海禁顿时严厉起来。

嘉靖二十七年（1548年）四月，他指派都司卢镗率明兵由海门区进兵，攻克倭寇巢穴双屿港，活捉日本人稽天和中原地区海盗许栋等，并筑塞双屿，堵击倭寇。又将捕获之通倭罪犯统统处死。朱纨的行动触犯了闽浙地主豪绅的利益，又因在日本贡使周良的处置问题上，与主客司、福建籍的林懋和发生矛盾，招致闽人官僚仇恨。七月，吏部采御史、闽人周亮及给事中叶镗言，奏改纨为巡视，以弱其权。纨愤而于次年春上疏争之，并陈明国是、正宪体、定纪纲、扼要害、除祸本、重断决六事。

嘉靖二十八年（1549年）三月，俘获海盗李光头等九十六人，亦尽诛之。在朱纨严格海禁之下，当地沿海逐渐产生不满情绪，并且越发严重，据《明史》记载：“闽人资衣食于海，骤失重利，虽士大夫家亦不便也，欲沮坏之。”朱纨前往讨伐温、盘、南麂诸贼，连战三月，大破敌军，还平息处州矿盗。

这一年的三月，佛郎机国人到诏安县进行抢劫。朱纨攻击擒获他们的头领李光头等九十六人，又用相机处理之法将他们杀戮。并将情况报告给皇帝，语言中又侵犯了诸势豪之家。御史陈九德于是弹劾朱纨擅自杀戮。于是免去朱纨的官职，命令兵科都给事中杜汝祯考察审问。朱纨听说后，慷慨流涕说：“我贫穷而且有病，又意气自负，不能对簿公堂。纵使皇帝不想杀我，闽、浙人一定会杀我。我死，自己解决，不须他人。”于是给自己写墓志，作绝命词，饮药而死。嘉靖二十九年(1550)，给事中杜汝祯、巡按御史陈宗夔回来，说是奸民鬻贩拒捕，没有号流劫之事，要问朱纨擅杀之罪。皇帝下诏令逮捕朱纨，朱纨在这以前已经死了。

朱纨清强峭直，勇于任事。想为国家杜绝祸乱的根源，才被势豪之家陷害，朝野人士都为他叹息。自从朱纨死后，罢去巡视大臣官职不设，朝廷内外都摇手不敢说海禁方面的事。浙中卫所四十一个，战船四百三十九艘，军籍尽为耗散。朱纨将福清捕获的盗船四十多艘，分布在海道，在台州海门卫的有十四艘，作为黄岩的外部屏障，副使丁湛全部将它们遣散，撤消防备放开海禁。自此，明朝海寇大作，荼毒东南有十多年。朱纨有后人所辑《甓余杂集》十二卷传世。

《明史》：①朱纨欲严海禁，以绝盗源，其论甚正。②纨执法既坚，势家皆惧。③纨清强峭直，勇于任事。

朱纨提督浙、闽海防军务期间，在闽浙沿海厉行保甲连坐制度，大力整顿海防；嘉靖二十七年派都司卢镗攻克倭寇巢穴双屿港，又在次年令卢镗在走马溪击败有葡萄牙人参与的海盗，取得走马溪大捷。

朱纨是典型的传统封建官吏，忠君爱国是他的主导思想，自己又是正直无私，为官清廉。时闽浙地主豪绅多暗地进行走私，从表面上看应该是支持开海禁的，但他们因走私而得到巨大的利益而反对开海进行贸易，从而能让对外交易（走私）掌握在自己手朱纨看到闽浙的武装走私集团已和葡萄牙、日本等武装走私集团结为利益集团，国家在基层的管理机构形同虚设，国家利益受到严重损失，有的岛屿已成独立王国。他决定在闽浙实行在政府监控下的对外贸易制度，对武装走私的中外船只进行打击，并对通风报信的岸是中国内奸实行严厉惩罚措施，他的坚决打击措施，导致当时既得利益获得者受到损失，地方和朝廷中的闽浙籍官僚联合对朱纨进行诬告，这才是朱纨被罢的根本原因。明时闽浙沿海地区豪绅从走私活动中获大益，当地人民不思好好种粮，以参与走私讨海洋生活成为从属的得益者，朱纨的政策维护了国家利益，使当地一些人受到严重打击，而被视作眼中钉。朱纨被迫害致死后，东南海防废弛，闽浙沿海人民和地主豪绅都深受其益，但中原地区的倭害从此越来越烈，国势也越来越衰弱，作为大明皇朝的财赋重地、已有资本主义萌芽的东南地区，受到倭寇的毒害，元气大伤。

朱纨逝世后，苏州市人民为纪念他，将他曾居住过的一条巷，命名为朱进士巷。

《明史·卷二百五·列传第九十三》